More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1493 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1493  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
250 aa  500  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  56.07 
 
 
261 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  52.97 
 
 
266 aa  248  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  52.84 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  51.69 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  53.28 
 
 
264 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.84 
 
 
275 aa  241  9e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.84 
 
 
275 aa  241  9e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  52.4 
 
 
275 aa  240  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.4 
 
 
275 aa  239  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  51.53 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  51.53 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  51.53 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  50.42 
 
 
271 aa  239  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  51.09 
 
 
275 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1450  undecaprenyl diphosphate synthase  54.11 
 
 
255 aa  235  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.207922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  51.53 
 
 
252 aa  235  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  51.27 
 
 
264 aa  235  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1408  undecaprenyl pyrophosphate synthetase protein  51.53 
 
 
258 aa  234  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  50.85 
 
 
274 aa  234  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  51.97 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  50 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
252 aa  232  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
252 aa  232  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
252 aa  232  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
244 aa  233  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.3 
 
 
256 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  51.3 
 
 
253 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.81 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  51.3 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.78 
 
 
238 aa  232  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.35 
 
 
238 aa  231  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.42 
 
 
250 aa  231  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.44 
 
 
253 aa  231  8.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  47.92 
 
 
268 aa  230  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
258 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
258 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.43 
 
 
261 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
252 aa  229  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  46.64 
 
 
256 aa  229  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  47.62 
 
 
288 aa  228  6e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
252 aa  228  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0743722  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  47.23 
 
 
246 aa  228  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  52.79 
 
 
260 aa  228  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.62 
 
 
252 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.62 
 
 
252 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.62 
 
 
252 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.62 
 
 
252 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.62 
 
 
252 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1018  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.13 
 
 
252 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000425553  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
249 aa  226  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.13 
 
 
252 aa  226  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.13 
 
 
252 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  51.5 
 
 
260 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0567  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.74 
 
 
252 aa  226  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
257 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
252 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.22 
 
 
251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  46.91 
 
 
253 aa  224  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  51.29 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  45.8 
 
 
251 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  51.29 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.36 
 
 
237 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.21 
 
 
257 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.05 
 
 
251 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  43.83 
 
 
236 aa  223  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  45.53 
 
 
236 aa  223  3e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
260 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
260 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
260 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  51.52 
 
 
254 aa  222  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
260 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.54 
 
 
248 aa  222  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.85 
 
 
251 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
257 aa  221  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.13 
 
 
249 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  44.54 
 
 
254 aa  220  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  50.64 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  45.61 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  50.64 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.44 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.7 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2972  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.906819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.57 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.38 
 
 
241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
258 aa  219  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
252 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  44.68 
 
 
236 aa  219  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  46.86 
 
 
273 aa  218  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
249 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>