More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1450 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1450  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
255 aa  525  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.207922  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  51.22 
 
 
261 aa  258  8e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  53.28 
 
 
271 aa  253  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  52.84 
 
 
264 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.21 
 
 
241 aa  251  8.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  52 
 
 
262 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  51.07 
 
 
254 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  53.28 
 
 
264 aa  250  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  50.42 
 
 
256 aa  248  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  51.21 
 
 
263 aa  248  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  53.91 
 
 
251 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.51 
 
 
251 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  51.9 
 
 
275 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  51.9 
 
 
275 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  51.9 
 
 
275 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.51 
 
 
251 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  53.28 
 
 
266 aa  246  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  51.48 
 
 
275 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
252 aa  246  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
253 aa  245  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  49.59 
 
 
252 aa  245  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
253 aa  245  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
252 aa  245  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
252 aa  245  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
253 aa  245  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
253 aa  245  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  49.59 
 
 
253 aa  245  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  50.81 
 
 
266 aa  245  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  54.32 
 
 
251 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  53.59 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  53.59 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  54.01 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  54.85 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38950  undecaprenyl diphosphate synthase  54.85 
 
 
251 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.522438  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  50.63 
 
 
275 aa  242  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  52.42 
 
 
260 aa  241  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  51.08 
 
 
246 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.63 
 
 
275 aa  241  9e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
252 aa  240  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.07 
 
 
251 aa  240  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0567  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.36 
 
 
252 aa  240  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1018  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
252 aa  240  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000425553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
252 aa  240  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  52.42 
 
 
260 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
275 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  52.42 
 
 
260 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
275 aa  240  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.16 
 
 
251 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1493  undecaprenyl diphosphate synthase  53.28 
 
 
250 aa  239  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  51.53 
 
 
274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
253 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  48.07 
 
 
251 aa  238  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.32 
 
 
252 aa  238  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  51.6 
 
 
260 aa  238  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
253 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
253 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  49.59 
 
 
275 aa  238  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  51.61 
 
 
260 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  51.61 
 
 
260 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  51.61 
 
 
260 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
252 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  52.23 
 
 
260 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.61 
 
 
260 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  52.23 
 
 
260 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  52.23 
 
 
260 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  52.23 
 
 
260 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  52.23 
 
 
260 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  52.23 
 
 
260 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  52.23 
 
 
260 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.93 
 
 
257 aa  236  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.84 
 
 
252 aa  236  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0743722  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.65 
 
 
248 aa  235  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  50.81 
 
 
260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
253 aa  235  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.74 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  51.03 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.97 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
238 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.21 
 
 
260 aa  232  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.74 
 
 
256 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  51.21 
 
 
260 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.21 
 
 
238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  48.36 
 
 
257 aa  232  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  47.58 
 
 
244 aa  232  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  51.72 
 
 
258 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  51.72 
 
 
258 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  48.18 
 
 
254 aa  231  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  46.86 
 
 
256 aa  229  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.07 
 
 
255 aa  227  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2972  undecaprenyl diphosphate synthase  45.71 
 
 
259 aa  227  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.906819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
248 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.28 
 
 
285 aa  226  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  48.7 
 
 
257 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1276  undecaprenyl diphosphate synthase  45.24 
 
 
243 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0784677  normal  0.545818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1762  undecaprenyl diphosphate synthase  48.13 
 
 
240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.430712  normal  0.0678846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>