More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1945 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1945  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
231 aa  477  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.77987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  65.04 
 
 
233 aa  309  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  64.71 
 
 
247 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  59.46 
 
 
250 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.11 
 
 
243 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0518  undecaprenyl diphosphate synthase  61.99 
 
 
280 aa  269  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
249 aa  254  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
253 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
253 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
256 aa  247  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  44.84 
 
 
232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.78 
 
 
259 aa  234  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.02 
 
 
251 aa  230  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 
264 aa  229  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  47.37 
 
 
249 aa  229  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  44.74 
 
 
244 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.46 
 
 
258 aa  228  6e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  46.52 
 
 
236 aa  228  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  45.65 
 
 
236 aa  227  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.49 
 
 
247 aa  227  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  46.05 
 
 
263 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.49 
 
 
238 aa  226  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  46.98 
 
 
240 aa  226  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  47.16 
 
 
266 aa  225  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.3 
 
 
267 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  43.42 
 
 
251 aa  224  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  45.22 
 
 
236 aa  224  9e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.61 
 
 
249 aa  224  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.86 
 
 
256 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.61 
 
 
238 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  45.61 
 
 
257 aa  223  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.4 
 
 
259 aa  224  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.86 
 
 
256 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.34 
 
 
237 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  48.44 
 
 
255 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.42 
 
 
267 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.05 
 
 
249 aa  221  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.49 
 
 
252 aa  221  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  47.77 
 
 
236 aa  221  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  47.77 
 
 
236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  45.74 
 
 
228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  46.26 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.23 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  45.13 
 
 
245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.37 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
246 aa  218  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.11 
 
 
249 aa  218  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.58 
 
 
256 aa  218  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  46.05 
 
 
247 aa  218  6e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  44.74 
 
 
288 aa  217  1e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  48.67 
 
 
251 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.02 
 
 
246 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.87 
 
 
258 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.61 
 
 
249 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.72 
 
 
250 aa  215  4e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.67 
 
 
260 aa  215  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  44.64 
 
 
241 aa  215  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  46.9 
 
 
285 aa  215  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.33 
 
 
251 aa  215  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.78 
 
 
282 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  45.98 
 
 
231 aa  214  7e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.22 
 
 
249 aa  214  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.73 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  45.98 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  45.22 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  48.46 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.73 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  44.25 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  44.74 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.74 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.42 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.61 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  43.81 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.3 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  42.17 
 
 
234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.86 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  43.81 
 
 
291 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.49 
 
 
244 aa  211  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  45.33 
 
 
265 aa  211  9e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  43.81 
 
 
272 aa  211  9e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.54 
 
 
266 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.72 
 
 
257 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.3 
 
 
265 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  45.54 
 
 
258 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.42 
 
 
249 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2435  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.92 
 
 
244 aa  211  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000170517  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.37 
 
 
243 aa  210  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  46.26 
 
 
257 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.69 
 
 
246 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.9 
 
 
254 aa  209  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1408  undecaprenyl pyrophosphate synthetase protein  45.54 
 
 
258 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  45.54 
 
 
257 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  42.92 
 
 
276 aa  210  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  43.36 
 
 
240 aa  209  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  43.36 
 
 
262 aa  209  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.64 
 
 
261 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.74 
 
 
260 aa  208  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.060942  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  45.09 
 
 
258 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>