More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0518 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0518  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
280 aa  569  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  66.67 
 
 
247 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.32 
 
 
243 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  62.83 
 
 
233 aa  290  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1945  undecaprenyl diphosphate synthase  61.99 
 
 
231 aa  288  8e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.77987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  62.07 
 
 
250 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.52 
 
 
253 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.52 
 
 
253 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
249 aa  252  6e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  50.2 
 
 
241 aa  249  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  49.8 
 
 
256 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.34 
 
 
249 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.91 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
258 aa  243  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.06 
 
 
246 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
244 aa  242  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.7 
 
 
259 aa  241  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.21 
 
 
256 aa  241  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
246 aa  240  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  45.28 
 
 
282 aa  240  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.91 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  52.84 
 
 
252 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.41 
 
 
252 aa  238  9e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
232 aa  238  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  47.62 
 
 
251 aa  237  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
236 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  48.09 
 
 
257 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
234 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  49.13 
 
 
236 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  48.09 
 
 
257 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  52.4 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1408  undecaprenyl pyrophosphate synthetase protein  50.43 
 
 
258 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
260 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.03 
 
 
258 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.36 
 
 
257 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  48.1 
 
 
260 aa  232  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.95 
 
 
260 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  45.88 
 
 
266 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  47.7 
 
 
240 aa  231  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  48.52 
 
 
260 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
258 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.72 
 
 
247 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.63 
 
 
246 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  48.52 
 
 
260 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
258 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  48.52 
 
 
260 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  48.52 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.52 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  48.52 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  48.52 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
258 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
258 aa  229  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  48.74 
 
 
260 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  48.1 
 
 
260 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.74 
 
 
260 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
258 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  48.74 
 
 
260 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
258 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.85 
 
 
261 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
258 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
258 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  48.12 
 
 
261 aa  228  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
258 aa  228  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.04 
 
 
256 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  46.41 
 
 
276 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  48.15 
 
 
259 aa  228  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
237 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  48.32 
 
 
260 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  48.32 
 
 
260 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  48.32 
 
 
260 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
257 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  48.32 
 
 
260 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  48.43 
 
 
236 aa  226  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
258 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.41 
 
 
259 aa  227  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  48.12 
 
 
248 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.94 
 
 
282 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
258 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.09 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.51 
 
 
285 aa  225  7e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  48.55 
 
 
255 aa  225  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  47.09 
 
 
236 aa  224  8e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  47.53 
 
 
236 aa  225  8e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
247 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
262 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 
264 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
255 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.15 
 
 
256 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1827  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
247 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
251 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.96 
 
 
250 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  47.19 
 
 
247 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
247 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2174  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 
255 aa  222  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  47.86 
 
 
261 aa  221  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  43.98 
 
 
263 aa  222  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 
228 aa  221  8e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>