More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1923 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1923  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
234 aa  472  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  54.63 
 
 
251 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  55 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.55 
 
 
252 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.42 
 
 
256 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.55 
 
 
252 aa  236  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  54.55 
 
 
266 aa  234  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.09 
 
 
252 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  53.12 
 
 
266 aa  234  9e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.91 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.91 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  52.17 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.64 
 
 
252 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  52.7 
 
 
247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.18 
 
 
244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.18 
 
 
252 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.64 
 
 
252 aa  228  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0935  undecaprenyl diphosphate synthase  51.36 
 
 
238 aa  228  6e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.07 
 
 
251 aa  228  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.18 
 
 
251 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  52.63 
 
 
245 aa  227  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  52.61 
 
 
246 aa  227  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  52.21 
 
 
240 aa  227  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
246 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.91 
 
 
267 aa  226  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 
246 aa  225  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.27 
 
 
252 aa  225  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  53.18 
 
 
252 aa  225  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.78 
 
 
243 aa  224  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  51.82 
 
 
259 aa  224  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  51.82 
 
 
259 aa  224  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.27 
 
 
259 aa  223  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  52.73 
 
 
254 aa  223  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  47.51 
 
 
248 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.67 
 
 
237 aa  223  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  51.79 
 
 
254 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  49.33 
 
 
233 aa  223  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
263 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  47.51 
 
 
249 aa  223  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.18 
 
 
245 aa  221  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.73 
 
 
254 aa  221  7e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  50.45 
 
 
241 aa  221  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.73 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.27 
 
 
255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  48.18 
 
 
256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  53.64 
 
 
257 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.88 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.88 
 
 
249 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  48.26 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  51.34 
 
 
259 aa  218  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.1 
 
 
246 aa  218  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  49.09 
 
 
234 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.55 
 
 
249 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.09 
 
 
258 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.09 
 
 
258 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.09 
 
 
258 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.3 
 
 
249 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.09 
 
 
258 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.96 
 
 
285 aa  217  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.09 
 
 
258 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.09 
 
 
258 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  53.33 
 
 
255 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.96 
 
 
248 aa  217  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.45 
 
 
248 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.09 
 
 
258 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.82 
 
 
247 aa  216  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  46.7 
 
 
246 aa  216  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  46.7 
 
 
276 aa  216  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
247 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  48.46 
 
 
253 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.11 
 
 
243 aa  215  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.64 
 
 
249 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  49.09 
 
 
257 aa  215  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  48.64 
 
 
259 aa  214  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  46.36 
 
 
244 aa  213  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0486  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.18 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.42 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  50.45 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.42 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.18 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.78 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.55 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.18 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.18 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  48.9 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.18 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0690  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.49 
 
 
270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000341789  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  45.92 
 
 
282 aa  211  7e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.51 
 
 
249 aa  211  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  48.64 
 
 
228 aa  211  7.999999999999999e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  49.34 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  52.27 
 
 
259 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.9 
 
 
250 aa  211  9e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  53.18 
 
 
254 aa  210  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  46.29 
 
 
276 aa  209  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  49.09 
 
 
236 aa  209  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>