More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0417 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
258 aa  521  1e-147  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  56.22 
 
 
263 aa  300  1e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  56.4 
 
 
264 aa  298  4e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.6 
 
 
264 aa  293  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  53.23 
 
 
264 aa  285  4e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  56.8 
 
 
264 aa  281  6.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  51 
 
 
280 aa  270  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  49.24 
 
 
278 aa  271  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  48.59 
 
 
263 aa  264  1e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  50.4 
 
 
268 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.8 
 
 
276 aa  256  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.77 
 
 
292 aa  244  6.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.19 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  47.52 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  48.24 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.62 
 
 
253 aa  239  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  44.09 
 
 
253 aa  238  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
263 aa  238  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  48.57 
 
 
309 aa  236  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 
257 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.21 
 
 
253 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.21 
 
 
253 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  44.67 
 
 
266 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  48.98 
 
 
248 aa  235  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  47.15 
 
 
304 aa  234  8e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  41.86 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.62 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
258 aa  232  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  42.86 
 
 
283 aa  231  6e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  44.49 
 
 
256 aa  232  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
240 aa  231  8.000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  43.63 
 
 
255 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  41.8 
 
 
255 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.69 
 
 
257 aa  230  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.78 
 
 
283 aa  229  5e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
261 aa  228  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  43.03 
 
 
257 aa  228  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
340 aa  228  6e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.62 
 
 
252 aa  228  9e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.49 
 
 
258 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  45.38 
 
 
264 aa  226  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  43.1 
 
 
247 aa  226  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.84 
 
 
279 aa  226  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  40.54 
 
 
257 aa  225  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  44.92 
 
 
258 aa  225  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.62 
 
 
259 aa  225  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  41.31 
 
 
259 aa  225  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  46.06 
 
 
318 aa  225  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.35 
 
 
233 aa  224  9e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.43 
 
 
254 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
251 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  44.58 
 
 
257 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  46.5 
 
 
259 aa  223  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.25 
 
 
262 aa  223  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  44.36 
 
 
256 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.32 
 
 
267 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  42.62 
 
 
252 aa  222  6e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  41.77 
 
 
260 aa  221  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.31 
 
 
258 aa  221  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.31 
 
 
258 aa  221  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.31 
 
 
258 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.09 
 
 
249 aa  221  9e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.31 
 
 
258 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  43.02 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  42.02 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.31 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  42.24 
 
 
282 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.31 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  44.12 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.59 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.96 
 
 
248 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  44.63 
 
 
325 aa  220  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.31 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  44.35 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.89 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  42.19 
 
 
253 aa  219  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  43.7 
 
 
276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.69 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.26 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  38.65 
 
 
259 aa  218  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.89 
 
 
267 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.69 
 
 
241 aa  219  5e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  43.93 
 
 
251 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  38.91 
 
 
253 aa  218  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  44.54 
 
 
251 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  44.54 
 
 
251 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.12 
 
 
251 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.42 
 
 
259 aa  218  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.19 
 
 
258 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.53 
 
 
257 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  44.16 
 
 
291 aa  217  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.53 
 
 
258 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.41 
 
 
249 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  43.7 
 
 
268 aa  218  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  40.93 
 
 
285 aa  216  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  44.83 
 
 
251 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  40.23 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>