More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0263 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 		 292 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.85 
 
 		 283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  51.17 
 
 		 264 aa  278  1e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  49.42 
 
 		 309 aa  268  8.999999999999999e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  48.81 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  45.02 
 
 		 340 aa  261  6.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  47.06 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  48.15 
 
 		 259 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  47.79 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  47.41 
 
 		 258 aa  248  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  48.15 
 
 		 318 aa  247  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  47.77 
 
 		 258 aa  244  9e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  45.97 
 
 		 263 aa  238  9e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  45.9 
 
 		 264 aa  236  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  45.08 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0118  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.09 
 
 		 252 aa  236  4e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.9 
 
 		 264 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  45.02 
 
 		 268 aa  229  5e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  45.9 
 
 		 264 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  40.64 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  39.68 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  40.48 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  42.45 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.55 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.78 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  39.68 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.56 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.07 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  39.84 
 
 		 273 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  36.9 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  37.8 
 
 		 257 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  37.11 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.09 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.76 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.45 
 
 		 253 aa  176  5e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.68 
 
 		 257 aa  176  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.53 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40498  predicted protein  37.69 
 
 		 311 aa  175  7e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.563879  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  39.83 
 
 		 247 aa  175  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  37.94 
 
 		 253 aa  175  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  36.19 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  38.1 
 
 		 253 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.15 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  40.26 
 
 		 261 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.49 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.97 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.46 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.51 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  37.93 
 
 		 240 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 254 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  40.34 
 
 		 239 aa  172  6.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39 
 
 		 267 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  38.89 
 
 		 252 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.26 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  36.95 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  39.48 
 
 		 251 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  40.77 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  37.45 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.27 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  36.76 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.71 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  37.7 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  39.91 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  36.82 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  38.78 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  36.64 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.06 
 
 		 251 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.17 
 
 		 267 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  35.02 
 
 		 283 aa  169  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  38.56 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  35.8 
 
 		 253 aa  168  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 		 228 aa  168  9e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.97 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  40.5 
 
 		 244 aa  168  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  39.39 
 
 		 240 aa  168  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  36.08 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.78 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.55 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.72 
 
 		 246 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.97 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  39.15 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  38.52 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.48 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  38.53 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  37.45 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.97 
 
 		 256 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.39 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  36.11 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  36.82 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  33.96 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.79 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.02 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>