More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2063 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
340 aa  669    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  65.71 
 
 
318 aa  398  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  65.4 
 
 
309 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  64.48 
 
 
325 aa  373  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  65.97 
 
 
304 aa  363  2e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.02 
 
 
292 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  51.6 
 
 
258 aa  260  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  51.85 
 
 
264 aa  259  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
256 aa  256  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  52.23 
 
 
255 aa  249  5e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  51.01 
 
 
259 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.21 
 
 
283 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  45.16 
 
 
263 aa  241  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0118  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.96 
 
 
252 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
258 aa  228  9e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  44.78 
 
 
264 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  43.91 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.45 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  45.35 
 
 
268 aa  209  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  43.27 
 
 
264 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.39 
 
 
262 aa  194  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  39.3 
 
 
272 aa  192  7e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 
239 aa  192  8e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.4 
 
 
243 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  38.37 
 
 
263 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  40.41 
 
 
278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  44.59 
 
 
264 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.43 
 
 
267 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  37.45 
 
 
276 aa  186  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  40.43 
 
 
291 aa  186  6e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.02 
 
 
259 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  40.17 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.24 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.6 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.09 
 
 
253 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.09 
 
 
253 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.4 
 
 
267 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  37.65 
 
 
248 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  39.39 
 
 
280 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  42.54 
 
 
247 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  39.3 
 
 
264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.13 
 
 
258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.84 
 
 
258 aa  180  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  38.76 
 
 
255 aa  180  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  38.03 
 
 
276 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.52 
 
 
254 aa  179  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  37.39 
 
 
251 aa  179  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 
266 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  38.79 
 
 
240 aa  176  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  38.43 
 
 
246 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  42.06 
 
 
259 aa  176  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.24 
 
 
267 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  39.33 
 
 
257 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  38.43 
 
 
263 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  37.3 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  37.28 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.23 
 
 
233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  35.6 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  39.15 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  40.35 
 
 
273 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.13 
 
 
275 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.2 
 
 
257 aa  173  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  41.13 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.74 
 
 
222 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.18 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  39.53 
 
 
252 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  36.09 
 
 
285 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  35.93 
 
 
288 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  38.33 
 
 
261 aa  172  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.13 
 
 
275 aa  172  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.13 
 
 
275 aa  172  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.55 
 
 
252 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  38.7 
 
 
266 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  38.7 
 
 
275 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.23 
 
 
251 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  39.91 
 
 
266 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  39.61 
 
 
260 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.9 
 
 
282 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  36.61 
 
 
253 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  37.39 
 
 
275 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  37.39 
 
 
275 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  37.39 
 
 
275 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  37.55 
 
 
256 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  36.52 
 
 
263 aa  170  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  37.83 
 
 
275 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.22 
 
 
252 aa  169  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1018  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.89 
 
 
252 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000425553  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  37.39 
 
 
275 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.89 
 
 
252 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.89 
 
 
252 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  38.53 
 
 
274 aa  169  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 
257 aa  169  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  38.22 
 
 
252 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  38.22 
 
 
253 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.22 
 
 
253 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.22 
 
 
252 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.22 
 
 
253 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.98 
 
 
279 aa  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>