More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1084 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  74.09 
 
 		 253 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.56 
 
 		 251 aa  362  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.68 
 
 		 279 aa  358  7e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  69.64 
 
 		 253 aa  345  5e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.67 
 
 		 258 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  66.4 
 
 		 271 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  64.82 
 
 		 253 aa  334  5.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  64.66 
 
 		 259 aa  333  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  65.49 
 
 		 255 aa  332  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  63.49 
 
 		 253 aa  316  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  60.78 
 
 		 257 aa  314  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  62.45 
 
 		 253 aa  313  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.4 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  62.79 
 
 		 259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.94 
 
 		 254 aa  311  9e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  62.75 
 
 		 256 aa  310  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  62.35 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  60.08 
 
 		 259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.08 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  59.45 
 
 		 255 aa  296  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  57.54 
 
 		 260 aa  287  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.59 
 
 		 257 aa  285  4e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  54.25 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.38 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  58.33 
 
 		 281 aa  275  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  55.69 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  54.47 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  53.39 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  53.33 
 
 		 263 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.59 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  52.55 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.78 
 
 		 259 aa  257  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.84 
 
 		 276 aa  245  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  48.09 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.14 
 
 		 263 aa  241  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.14 
 
 		 263 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  47.22 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.38 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  50.79 
 
 		 283 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  43.03 
 
 		 258 aa  228  6e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  40.94 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  42.63 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.43 
 
 		 264 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  40.24 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  44.88 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  41.83 
 
 		 264 aa  204  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  37.4 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.67 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.86 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.68 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.53 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  36.18 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  43.19 
 
 		 264 aa  181  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.15 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.58 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.8 
 
 		 292 aa  178  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  37.66 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  39.09 
 
 		 249 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.82 
 
 		 258 aa  174  9e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.86 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.93 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.93 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  38.81 
 
 		 289 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 		 240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  37.65 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.34 
 
 		 249 aa  171  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  37.77 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  40.4 
 
 		 264 aa  171  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  39.48 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  37.07 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.38 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.46 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.29 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.29 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.5 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  35.89 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 		 340 aa  168  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.95 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_002978  WD0527  undecaprenyl diphosphate synthase  33.61 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  39.66 
 
 		 259 aa  168  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.24 
 
 		 243 aa  168  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.92 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  39.85 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  37.13 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  35.19 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  36.4 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.06 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.27 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  36.6 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  36.48 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.03 
 
 		 248 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  36.91 
 
 		 252 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  35.94 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.06 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  32.39 
 
 		 267 aa  164  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.61 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0944  undecaprenyl diphosphate synthase  37.61 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0337161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>