More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0590 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
264 aa  544  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  92.8 
 
 
264 aa  510  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  91.29 
 
 
264 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  79.92 
 
 
264 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  62.21 
 
 
263 aa  362  3e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  56.8 
 
 
258 aa  297  1e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  47.81 
 
 
263 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  46.8 
 
 
278 aa  244  9e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  45.6 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.02 
 
 
276 aa  242  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  44.27 
 
 
268 aa  237  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.9 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  43.24 
 
 
257 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  44.49 
 
 
264 aa  224  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.83 
 
 
257 aa  224  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.17 
 
 
258 aa  223  4e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  42.06 
 
 
253 aa  222  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  44.76 
 
 
256 aa  221  9e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  41.11 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  43.27 
 
 
340 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.96 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  40.08 
 
 
271 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  42.69 
 
 
253 aa  218  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.72 
 
 
283 aa  218  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  43.72 
 
 
309 aa  217  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.8 
 
 
279 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  44.35 
 
 
263 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.18 
 
 
259 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  41.83 
 
 
257 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  41.02 
 
 
258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.74 
 
 
249 aa  214  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  41.18 
 
 
260 aa  214  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  40.8 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  40.94 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  41.5 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.63 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.83 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.8 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  40.32 
 
 
256 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  41.83 
 
 
259 aa  211  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  42.68 
 
 
304 aa  211  9e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  41.67 
 
 
253 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.87 
 
 
254 aa  209  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  45.22 
 
 
258 aa  209  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  44.31 
 
 
246 aa  208  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.4 
 
 
262 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  40.24 
 
 
325 aa  206  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  38.25 
 
 
259 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.3 
 
 
253 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.3 
 
 
253 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  40.91 
 
 
318 aa  205  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  40.71 
 
 
256 aa  205  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  43.37 
 
 
253 aa  202  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  41.67 
 
 
256 aa  201  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  37.7 
 
 
259 aa  201  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  39.13 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.34 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  42.86 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.15 
 
 
233 aa  199  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  41.67 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.19 
 
 
259 aa  198  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.03 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  39.04 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  39.84 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  39.13 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  42.49 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  42.92 
 
 
282 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  43.78 
 
 
246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  42.74 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  44.17 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0979  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.48 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00602167  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.08 
 
 
259 aa  196  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  39.45 
 
 
263 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  41.63 
 
 
247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  39.61 
 
 
262 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  41.8 
 
 
260 aa  194  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  41.53 
 
 
262 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  42.49 
 
 
276 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  44.4 
 
 
240 aa  193  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  40.15 
 
 
281 aa  192  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  41.15 
 
 
255 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.59 
 
 
249 aa  192  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.75 
 
 
256 aa  192  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.68 
 
 
259 aa  192  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  42.49 
 
 
276 aa  191  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.55 
 
 
259 aa  191  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  45.38 
 
 
245 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.15 
 
 
233 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.02 
 
 
257 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  40.5 
 
 
259 aa  190  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  41.35 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.59 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  39.91 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 
238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.24 
 
 
251 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.86 
 
 
267 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.16 
 
 
249 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.49 
 
 
263 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>