More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8524 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  100 
 
 
255 aa  517  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  81.89 
 
 
253 aa  435  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  74.41 
 
 
271 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  66.27 
 
 
253 aa  353  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  66.67 
 
 
259 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.27 
 
 
254 aa  347  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  68.24 
 
 
279 aa  347  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  64.73 
 
 
257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  65.49 
 
 
257 aa  332  5e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.43 
 
 
259 aa  328  6e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  62.93 
 
 
259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  64.59 
 
 
256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.92 
 
 
258 aa  321  7e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  61.57 
 
 
253 aa  318  3.9999999999999996e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  64.2 
 
 
256 aa  318  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  64.66 
 
 
253 aa  315  4e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  59.77 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.8 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  61.66 
 
 
281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  59.53 
 
 
256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  61.2 
 
 
253 aa  301  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  59.06 
 
 
262 aa  301  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  57.65 
 
 
263 aa  298  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  59.2 
 
 
259 aa  298  6e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  57.25 
 
 
265 aa  298  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  57.53 
 
 
258 aa  295  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.5 
 
 
262 aa  293  3e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  59.36 
 
 
257 aa  291  7e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  56.47 
 
 
260 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.15 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.86 
 
 
253 aa  282  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.96 
 
 
263 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.96 
 
 
263 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.37 
 
 
246 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.3 
 
 
259 aa  266  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.6 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  46.85 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 
278 aa  240  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 
276 aa  239  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  43.63 
 
 
258 aa  231  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  47.06 
 
 
283 aa  228  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  43.24 
 
 
263 aa  223  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  42.13 
 
 
264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.34 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  39.76 
 
 
264 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  47.37 
 
 
264 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  41.73 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.92 
 
 
249 aa  198  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  45.14 
 
 
268 aa  194  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  39.23 
 
 
263 aa  192  4e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.4 
 
 
249 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.16 
 
 
249 aa  185  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.24 
 
 
233 aa  183  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.95 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.93 
 
 
253 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.93 
 
 
253 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.66 
 
 
258 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.95 
 
 
251 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  42.24 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.22 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  38.66 
 
 
249 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.95 
 
 
233 aa  179  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.23 
 
 
259 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  38.79 
 
 
234 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.35 
 
 
248 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  36.67 
 
 
245 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  39.66 
 
 
264 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  39.83 
 
 
233 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.8 
 
 
250 aa  175  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.71 
 
 
258 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.71 
 
 
258 aa  175  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.71 
 
 
258 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.71 
 
 
258 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.71 
 
 
258 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  36.63 
 
 
251 aa  175  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0979  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.21 
 
 
254 aa  175  6e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00602167  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.82 
 
 
255 aa  174  9e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  38.79 
 
 
263 aa  174  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  38.43 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.29 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  40.09 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.29 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  39.24 
 
 
236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.36 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.89 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.77 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.29 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.29 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  37.93 
 
 
232 aa  172  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.65 
 
 
282 aa  172  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.48 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  39.57 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.48 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  38.79 
 
 
246 aa  172  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  38.36 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.71 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  39.24 
 
 
236 aa  171  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0944  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 
230 aa  171  1e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0337161  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  37.6 
 
 
248 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>