More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1244 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
257 aa  529  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  90.91 
 
 
253 aa  485  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.42 
 
 
257 aa  322  3e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  57.94 
 
 
257 aa  295  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  59.68 
 
 
253 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.44 
 
 
254 aa  293  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.25 
 
 
279 aa  291  6e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.26 
 
 
258 aa  291  6e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  59.36 
 
 
255 aa  291  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  59.27 
 
 
271 aa  290  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  58.87 
 
 
253 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  56.05 
 
 
253 aa  284  9e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.2 
 
 
251 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  54.37 
 
 
259 aa  281  6.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  54.25 
 
 
257 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  53.33 
 
 
255 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.14 
 
 
259 aa  275  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  55.21 
 
 
259 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  54.37 
 
 
253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  53.17 
 
 
253 aa  273  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  53.47 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.82 
 
 
252 aa  268  7e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.94 
 
 
262 aa  267  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  54.94 
 
 
281 aa  260  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  52.99 
 
 
256 aa  258  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  54.44 
 
 
259 aa  255  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  52.19 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  54.4 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  53.78 
 
 
265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  53.39 
 
 
263 aa  251  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.61 
 
 
259 aa  246  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  47.81 
 
 
278 aa  246  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  47.41 
 
 
280 aa  246  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  49.4 
 
 
258 aa  244  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.06 
 
 
276 aa  241  7.999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  46.46 
 
 
263 aa  241  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  49.2 
 
 
256 aa  237  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 
258 aa  237  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.46 
 
 
263 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.05 
 
 
263 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.5 
 
 
246 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.8 
 
 
264 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  41.77 
 
 
264 aa  214  9e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  39.6 
 
 
264 aa  207  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  40.96 
 
 
264 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  42.75 
 
 
268 aa  206  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  41.54 
 
 
263 aa  204  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.49 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.78 
 
 
233 aa  199  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  40.71 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  42.06 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.33 
 
 
249 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  42.34 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.04 
 
 
249 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.26 
 
 
251 aa  188  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  41.56 
 
 
249 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.74 
 
 
255 aa  187  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  39.41 
 
 
239 aa  186  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.25 
 
 
259 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.44 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.68 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  43.51 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.32 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  41.3 
 
 
225 aa  183  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  39.27 
 
 
252 aa  182  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.24 
 
 
258 aa  181  9.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  38.34 
 
 
262 aa  181  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  37.82 
 
 
248 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.66 
 
 
253 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.66 
 
 
253 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  37.61 
 
 
272 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.42 
 
 
249 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  39.06 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  36.07 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  38.21 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  42.68 
 
 
236 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.59 
 
 
247 aa  178  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  38.27 
 
 
256 aa  178  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  41.25 
 
 
244 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  38.36 
 
 
234 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  37.77 
 
 
247 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.25 
 
 
256 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  39.45 
 
 
264 aa  176  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  39.48 
 
 
240 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  38.46 
 
 
252 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.93 
 
 
249 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.08 
 
 
260 aa  175  7e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.95 
 
 
267 aa  174  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  36.1 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  35.46 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.83 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.24 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  39.17 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.86 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.43 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.17 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.83 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.86 
 
 
267 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  37.34 
 
 
246 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>