More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3093 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  81.89 
 
 
255 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  79.28 
 
 
271 aa  421  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  69.84 
 
 
253 aa  370  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.92 
 
 
254 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  70.92 
 
 
259 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.17 
 
 
279 aa  358  4e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  65.37 
 
 
257 aa  345  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  65.62 
 
 
256 aa  343  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.14 
 
 
258 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  64.82 
 
 
253 aa  335  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  64.82 
 
 
257 aa  334  5.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  65.23 
 
 
256 aa  333  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  65.48 
 
 
259 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  66.4 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  62.5 
 
 
256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.16 
 
 
259 aa  323  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  61.81 
 
 
255 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.75 
 
 
262 aa  315  5e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.48 
 
 
251 aa  310  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  57.98 
 
 
258 aa  304  9.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  57.71 
 
 
259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  59.92 
 
 
253 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.37 
 
 
257 aa  296  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  60.32 
 
 
281 aa  293  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  58.87 
 
 
257 aa  290  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.92 
 
 
253 aa  287  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  54.76 
 
 
260 aa  285  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  55.51 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  54.12 
 
 
265 aa  279  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.98 
 
 
259 aa  278  8e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  53.73 
 
 
263 aa  276  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.21 
 
 
252 aa  265  5e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.28 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.28 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  49.41 
 
 
283 aa  248  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  48.81 
 
 
278 aa  247  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.67 
 
 
276 aa  247  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.11 
 
 
246 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  47.62 
 
 
280 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  44.09 
 
 
258 aa  238  5e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  43.7 
 
 
263 aa  228  7e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.27 
 
 
264 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  40.48 
 
 
264 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  41.67 
 
 
264 aa  217  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  42.86 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  40.94 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  43.92 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.68 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.25 
 
 
249 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.44 
 
 
249 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  40.93 
 
 
241 aa  191  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.03 
 
 
259 aa  188  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.59 
 
 
233 aa  188  9e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.39 
 
 
253 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.39 
 
 
253 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  40.32 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.34 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  40.98 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.91 
 
 
247 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.31 
 
 
233 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.73 
 
 
256 aa  181  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.73 
 
 
256 aa  181  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0979  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.6 
 
 
254 aa  181  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00602167  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0518  undecaprenyl diphosphate synthase  41.18 
 
 
280 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  39.57 
 
 
245 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  39.2 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.82 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.34 
 
 
249 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.91 
 
 
258 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.91 
 
 
257 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.48 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.48 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.48 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.48 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.94 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.48 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.48 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.48 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  37.13 
 
 
276 aa  177  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  37.82 
 
 
232 aa  177  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.06 
 
 
257 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  37.87 
 
 
246 aa  176  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.5 
 
 
251 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  39.48 
 
 
249 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.16 
 
 
259 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  39.57 
 
 
236 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  37.39 
 
 
247 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  40.87 
 
 
233 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.5 
 
 
292 aa  175  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.91 
 
 
258 aa  175  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.34 
 
 
258 aa  174  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  40.52 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1945  undecaprenyl diphosphate synthase  40.69 
 
 
231 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.77987 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  40.77 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  36.05 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  38.33 
 
 
244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  39.15 
 
 
236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.25 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.62 
 
 
256 aa  172  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>