More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4137 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
246 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
263 aa  500  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  99.59 
 
 
263 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  85.71 
 
 
265 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  85.71 
 
 
263 aa  431  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  83.27 
 
 
262 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  70.46 
 
 
281 aa  333  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  64.96 
 
 
260 aa  312  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.54 
 
 
259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  58.37 
 
 
255 aa  281  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  59.4 
 
 
259 aa  281  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  56.56 
 
 
255 aa  279  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  54.29 
 
 
257 aa  268  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  56.56 
 
 
259 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.81 
 
 
257 aa  261  6.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  54.55 
 
 
253 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  54.27 
 
 
271 aa  257  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  52.85 
 
 
258 aa  255  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  54.31 
 
 
256 aa  254  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.51 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  55.13 
 
 
253 aa  252  5.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  57.33 
 
 
253 aa  250  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  53.88 
 
 
256 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  52.48 
 
 
257 aa  248  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.41 
 
 
259 aa  247  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  51.03 
 
 
253 aa  246  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.07 
 
 
254 aa  246  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.22 
 
 
279 aa  246  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.74 
 
 
262 aa  243  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  53.22 
 
 
253 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.46 
 
 
253 aa  239  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  52.24 
 
 
257 aa  239  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.52 
 
 
251 aa  239  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  52.16 
 
 
259 aa  236  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.2 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
256 aa  232  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  43.85 
 
 
264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.21 
 
 
276 aa  206  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  41.15 
 
 
258 aa  206  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  42.45 
 
 
263 aa  203  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.98 
 
 
264 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  42.08 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  41.56 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 
278 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  44.4 
 
 
283 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  42.39 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.51 
 
 
249 aa  188  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.78 
 
 
253 aa  185  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.78 
 
 
253 aa  185  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  43.33 
 
 
268 aa  183  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  40.83 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  40.82 
 
 
241 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  38.56 
 
 
245 aa  176  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  40.95 
 
 
225 aa  174  9e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.24 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  37.14 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  40.51 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.97 
 
 
267 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  36.71 
 
 
246 aa  171  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.62 
 
 
259 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  36.89 
 
 
239 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  42.08 
 
 
236 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.08 
 
 
267 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  40.91 
 
 
264 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  38.87 
 
 
257 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  41.25 
 
 
236 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.71 
 
 
252 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.89 
 
 
247 aa  168  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.53 
 
 
246 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.24 
 
 
267 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  37.82 
 
 
263 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  36.89 
 
 
285 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  38.14 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.51 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  38.66 
 
 
266 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.51 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  35.86 
 
 
246 aa  165  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  36.25 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  35.39 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  41.22 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0944  undecaprenyl diphosphate synthase  40.08 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0337161  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.1 
 
 
249 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.45 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  36.1 
 
 
231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  40.42 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.67 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  34.98 
 
 
276 aa  162  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  36.44 
 
 
228 aa  162  6e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.08 
 
 
251 aa  161  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.7 
 
 
267 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  38.89 
 
 
249 aa  161  9e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.68 
 
 
248 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  38.72 
 
 
244 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  39.26 
 
 
238 aa  160  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.8 
 
 
257 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  36.17 
 
 
288 aa  159  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1157  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.08 
 
 
234 aa  159  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.15 
 
 
243 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.89 
 
 
249 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  34.98 
 
 
291 aa  159  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>