More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0863 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  96.88 
 
 		 256 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  69.53 
 
 		 256 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  65.23 
 
 		 253 aa  341  5e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  64.82 
 
 		 271 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  65.87 
 
 		 259 aa  335  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  65.22 
 
 		 259 aa  334  7.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  61.96 
 
 		 255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  64.2 
 
 		 255 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.17 
 
 		 259 aa  324  7e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.45 
 
 		 254 aa  319  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.43 
 
 		 279 aa  317  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  61.96 
 
 		 253 aa  315  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.45 
 
 		 258 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  62.35 
 
 		 257 aa  311  9e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  61 
 
 		 257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.76 
 
 		 251 aa  301  7.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  61.96 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  57.25 
 
 		 253 aa  298  6e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  59.22 
 
 		 253 aa  295  6e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  54.47 
 
 		 258 aa  293  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  55.73 
 
 		 260 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  57.31 
 
 		 281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.52 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.51 
 
 		 257 aa  278  7e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  54.69 
 
 		 259 aa  277  9e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.39 
 
 		 259 aa  271  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  51.37 
 
 		 265 aa  268  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  51.76 
 
 		 263 aa  268  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  50.98 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  52.19 
 
 		 257 aa  259  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.98 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.64 
 
 		 263 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.23 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.8 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.85 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  47.08 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.86 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  47.64 
 
 		 283 aa  228  6e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  42.02 
 
 		 258 aa  221  9e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  41.11 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.48 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  40.32 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  40.87 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  43.36 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  41.67 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.72 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.72 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.3 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  36.08 
 
 		 263 aa  178  7e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.49 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  38.03 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  37.45 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.75 
 
 		 258 aa  171  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  35.83 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  35.47 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  36.44 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  34.15 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  40.24 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.17 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  37.76 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  38.63 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  39.36 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.61 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.61 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.66 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  39.66 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  39.33 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.48 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.57 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  36.59 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.43 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.43 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.84 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.29 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  38.27 
 
 		 236 aa  162  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  37.97 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  35.19 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  38.43 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  39.66 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  36.73 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  36.97 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  39.06 
 
 		 340 aa  159  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  39.45 
 
 		 309 aa  159  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0518  undecaprenyl diphosphate synthase  38.98 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.27 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.86 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.37 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  36.17 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  36.13 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  37.6 
 
 		 236 aa  158  9e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  36.03 
 
 		 288 aa  158  9e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  37.74 
 
 		 289 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  33.9 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  38.15 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>