More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4413 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
255 aa  520  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  63.24 
 
 
259 aa  335  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.64 
 
 
259 aa  332  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  62.35 
 
 
256 aa  327  9e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  61.81 
 
 
253 aa  319  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  61.63 
 
 
281 aa  319  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  61.96 
 
 
256 aa  317  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  63.6 
 
 
259 aa  316  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  59.45 
 
 
260 aa  315  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.66 
 
 
254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  59.77 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  60.08 
 
 
271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  58.43 
 
 
256 aa  304  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.32 
 
 
258 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  57.42 
 
 
265 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.37 
 
 
257 aa  300  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.13 
 
 
251 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  58.66 
 
 
253 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.08 
 
 
262 aa  296  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  57.87 
 
 
253 aa  296  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  56.64 
 
 
263 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  59.45 
 
 
257 aa  296  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  56.47 
 
 
262 aa  294  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  56.3 
 
 
259 aa  289  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  58.27 
 
 
253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.08 
 
 
253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  57.87 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.13 
 
 
279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  53.49 
 
 
257 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  53.33 
 
 
257 aa  276  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.22 
 
 
252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  51.36 
 
 
258 aa  271  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.07 
 
 
263 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.07 
 
 
263 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.6 
 
 
259 aa  265  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.79 
 
 
246 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  45.7 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  47.04 
 
 
283 aa  230  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  41.8 
 
 
258 aa  230  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 
280 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46 
 
 
276 aa  219  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  41.5 
 
 
264 aa  218  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  40.78 
 
 
263 aa  218  5e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  42.69 
 
 
264 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.78 
 
 
264 aa  215  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  44.71 
 
 
268 aa  211  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  41.5 
 
 
264 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  41.57 
 
 
263 aa  195  6e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.55 
 
 
249 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.08 
 
 
253 aa  185  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.08 
 
 
253 aa  185  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  38.06 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  41.56 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.03 
 
 
233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 
232 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  39.24 
 
 
276 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  38.76 
 
 
340 aa  180  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.49 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  40.76 
 
 
241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.5 
 
 
282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  37.94 
 
 
262 aa  179  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.34 
 
 
255 aa  178  7e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  39.48 
 
 
234 aa  178  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  37.19 
 
 
282 aa  178  8e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  37.87 
 
 
245 aa  177  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  36.33 
 
 
263 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  42.28 
 
 
309 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.77 
 
 
233 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.19 
 
 
292 aa  175  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  38.72 
 
 
236 aa  174  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  38.82 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  37.65 
 
 
266 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.18 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  37.18 
 
 
285 aa  172  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  39.09 
 
 
249 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  39.41 
 
 
247 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  37.39 
 
 
252 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  36.44 
 
 
239 aa  171  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.09 
 
 
249 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  33.46 
 
 
260 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.24 
 
 
249 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  38.3 
 
 
236 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  37.13 
 
 
291 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  36.48 
 
 
272 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  36.02 
 
 
246 aa  169  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.8 
 
 
267 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  40.17 
 
 
264 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  38.34 
 
 
325 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.85 
 
 
243 aa  168  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  36.05 
 
 
228 aa  168  8e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  37.45 
 
 
257 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 
240 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.48 
 
 
243 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  38.62 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.55 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  38.59 
 
 
250 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.85 
 
 
252 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  38.43 
 
 
304 aa  166  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>