More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31580 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
259 aa  528  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  70.27 
 
 
259 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  63.64 
 
 
255 aa  332  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  64.43 
 
 
255 aa  328  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  65.35 
 
 
256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  62.16 
 
 
253 aa  323  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  62.8 
 
 
271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  62.31 
 
 
259 aa  317  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  61.26 
 
 
260 aa  317  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  64.17 
 
 
256 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  61.81 
 
 
281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.6 
 
 
258 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  58.2 
 
 
265 aa  304  8.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  58.2 
 
 
263 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  63.08 
 
 
257 aa  300  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.04 
 
 
254 aa  298  6e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.26 
 
 
279 aa  298  9e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  59.46 
 
 
257 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.5 
 
 
251 aa  291  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  56.47 
 
 
262 aa  290  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  59.68 
 
 
253 aa  290  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  56.92 
 
 
253 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  58.08 
 
 
253 aa  285  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  60.87 
 
 
253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.77 
 
 
257 aa  280  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  55.12 
 
 
256 aa  279  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  56.92 
 
 
259 aa  276  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  57.14 
 
 
257 aa  275  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.5 
 
 
263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  52.57 
 
 
258 aa  270  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.1 
 
 
263 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.98 
 
 
259 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.87 
 
 
246 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56 
 
 
262 aa  265  5e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.36 
 
 
253 aa  260  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.4 
 
 
252 aa  255  6e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  47.92 
 
 
280 aa  248  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
278 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.2 
 
 
276 aa  224  8e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 
258 aa  214  8e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  47.64 
 
 
283 aa  214  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  41.96 
 
 
263 aa  209  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  43.75 
 
 
268 aa  206  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.44 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 
264 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  41.35 
 
 
264 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  42.62 
 
 
264 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41 
 
 
249 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  40.17 
 
 
266 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  41.49 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.5 
 
 
253 aa  178  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.5 
 
 
253 aa  178  9e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  38.82 
 
 
248 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  36.47 
 
 
263 aa  175  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.08 
 
 
259 aa  171  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  36.02 
 
 
262 aa  171  9e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.91 
 
 
258 aa  170  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  40.17 
 
 
241 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  36.91 
 
 
272 aa  169  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  40.25 
 
 
234 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  41.42 
 
 
236 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 
228 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.34 
 
 
259 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  38.56 
 
 
256 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 
251 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.57 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.18 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  37.24 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  37.77 
 
 
246 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  38.98 
 
 
247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.12 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.12 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.12 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.66 
 
 
233 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.12 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.7 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.12 
 
 
258 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.12 
 
 
258 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.12 
 
 
258 aa  165  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.12 
 
 
258 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.12 
 
 
258 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.83 
 
 
233 aa  164  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  38.56 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  38.14 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  35.98 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  41 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.51 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  34.57 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  37.66 
 
 
285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  33.47 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  38.2 
 
 
225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  38.56 
 
 
264 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.56 
 
 
243 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  39.43 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  35.8 
 
 
276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.51 
 
 
258 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.91 
 
 
249 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  36.48 
 
 
276 aa  159  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.5 
 
 
255 aa  159  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.45 
 
 
249 aa  158  8e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>