More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0456 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  74.5 
 
 
253 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  72.51 
 
 
271 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  70.92 
 
 
253 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  66.27 
 
 
255 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  66.13 
 
 
259 aa  329  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.87 
 
 
279 aa  323  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.29 
 
 
258 aa  322  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  60.47 
 
 
257 aa  320  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  63.24 
 
 
256 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  63.89 
 
 
253 aa  318  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  61.57 
 
 
256 aa  312  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  62.65 
 
 
259 aa  311  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  61.94 
 
 
257 aa  311  7.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.9 
 
 
257 aa  310  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  64.11 
 
 
253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  58.66 
 
 
255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  62.45 
 
 
256 aa  308  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  61.29 
 
 
253 aa  299  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.04 
 
 
259 aa  298  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  60.32 
 
 
259 aa  296  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.29 
 
 
262 aa  294  9e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.11 
 
 
251 aa  293  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  59.44 
 
 
257 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.23 
 
 
253 aa  290  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  55.04 
 
 
281 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.47 
 
 
252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  54.51 
 
 
265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.44 
 
 
259 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  53.73 
 
 
263 aa  270  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  53.94 
 
 
262 aa  267  8.999999999999999e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  51.95 
 
 
278 aa  266  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  52.38 
 
 
260 aa  265  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  52.59 
 
 
258 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  50.59 
 
 
280 aa  262  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  50.4 
 
 
283 aa  245  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.46 
 
 
263 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.46 
 
 
263 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.19 
 
 
276 aa  241  6e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.95 
 
 
246 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  41.43 
 
 
258 aa  224  9e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  41.7 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  43.31 
 
 
263 aa  218  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  47.49 
 
 
268 aa  216  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.11 
 
 
264 aa  215  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  40.48 
 
 
264 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  47.76 
 
 
264 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  38.61 
 
 
264 aa  203  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  40.87 
 
 
264 aa  201  9e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.6 
 
 
249 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.92 
 
 
259 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.63 
 
 
247 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  44.4 
 
 
264 aa  186  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  41.81 
 
 
234 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.83 
 
 
249 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.09 
 
 
253 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.09 
 
 
253 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  43.78 
 
 
236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  41.81 
 
 
245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  41.8 
 
 
247 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  42.02 
 
 
241 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  40.61 
 
 
289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  38.52 
 
 
340 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.06 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0944  undecaprenyl diphosphate synthase  39.66 
 
 
230 aa  177  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0337161  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  40.34 
 
 
239 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  43.35 
 
 
236 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  39.48 
 
 
248 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  36.21 
 
 
282 aa  176  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  39.23 
 
 
262 aa  176  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.36 
 
 
258 aa  176  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  38.21 
 
 
263 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.53 
 
 
292 aa  175  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.92 
 
 
259 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.4 
 
 
233 aa  175  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2592  undecaprenyl diphosphate synthase  39.15 
 
 
238 aa  175  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.427666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  38.21 
 
 
266 aa  175  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  38.49 
 
 
232 aa  175  8e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  37.93 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.67 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.66 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  38.66 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  40.77 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.24 
 
 
246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.77 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  39.75 
 
 
244 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.92 
 
 
246 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  36.18 
 
 
285 aa  172  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  39.66 
 
 
225 aa  172  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 
236 aa  171  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1945  undecaprenyl diphosphate synthase  40.68 
 
 
231 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.77987 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.23 
 
 
222 aa  171  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  38.36 
 
 
276 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_002978  WD0527  undecaprenyl diphosphate synthase  35.42 
 
 
231 aa  171  1e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.09 
 
 
243 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  42.56 
 
 
259 aa  171  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.82 
 
 
249 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  39.66 
 
 
249 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>