More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1106 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
253 aa  503  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.57 
 
 
279 aa  357  7e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  66.4 
 
 
271 aa  348  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  64.82 
 
 
253 aa  340  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.29 
 
 
258 aa  331  5e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  65.87 
 
 
259 aa  329  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  63.49 
 
 
257 aa  329  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.89 
 
 
254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  61.57 
 
 
255 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.97 
 
 
251 aa  320  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  61.02 
 
 
253 aa  318  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  61.9 
 
 
253 aa  316  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  62.16 
 
 
259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  58.37 
 
 
257 aa  309  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.2 
 
 
262 aa  306  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  62.6 
 
 
253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  60 
 
 
259 aa  305  6e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.59 
 
 
257 aa  301  9e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.1 
 
 
253 aa  299  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  57.25 
 
 
256 aa  298  5e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  57.25 
 
 
256 aa  294  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  57.87 
 
 
255 aa  291  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.08 
 
 
259 aa  289  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  56.05 
 
 
257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  55.69 
 
 
256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  57.94 
 
 
260 aa  279  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  58.1 
 
 
281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  54.51 
 
 
265 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  53.49 
 
 
258 aa  265  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  52.94 
 
 
263 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.17 
 
 
259 aa  260  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  53.94 
 
 
262 aa  259  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.04 
 
 
252 aa  256  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.29 
 
 
263 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.29 
 
 
263 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.01 
 
 
246 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  49.4 
 
 
278 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.22 
 
 
276 aa  238  6.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  48.21 
 
 
280 aa  238  8e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  41.41 
 
 
258 aa  224  9e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  40.32 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  40.71 
 
 
263 aa  208  6e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  42.17 
 
 
264 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.17 
 
 
264 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.84 
 
 
249 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  46.25 
 
 
283 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  41.11 
 
 
264 aa  203  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  42.97 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.44 
 
 
258 aa  198  6e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  40.98 
 
 
256 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  45.15 
 
 
264 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.03 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  42.32 
 
 
249 aa  189  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  39.08 
 
 
246 aa  189  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 
240 aa  189  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  46.12 
 
 
264 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  39.08 
 
 
232 aa  187  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.87 
 
 
253 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.87 
 
 
253 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.62 
 
 
249 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.21 
 
 
249 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.75 
 
 
247 aa  185  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  40.42 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.78 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  41.1 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.7 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  39.48 
 
 
228 aa  184  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  38.06 
 
 
248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.06 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  43.21 
 
 
247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  44.26 
 
 
254 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  36.93 
 
 
246 aa  183  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2592  undecaprenyl diphosphate synthase  38.98 
 
 
238 aa  183  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.427666  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.13 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  36.86 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.13 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  39.51 
 
 
263 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  40.83 
 
 
266 aa  181  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  40.52 
 
 
276 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  40.69 
 
 
225 aa  180  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.45 
 
 
251 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.94 
 
 
292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  39.58 
 
 
244 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  41.35 
 
 
252 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.06 
 
 
259 aa  178  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  39.66 
 
 
272 aa  178  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  38.68 
 
 
257 aa  178  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.8 
 
 
267 aa  178  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.26 
 
 
256 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.63 
 
 
257 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  41.08 
 
 
255 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  38.36 
 
 
276 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.74 
 
 
255 aa  176  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.25 
 
 
249 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36359  predicted protein  42.44 
 
 
266 aa  176  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.091025  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.25 
 
 
249 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.83 
 
 
249 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0518  undecaprenyl diphosphate synthase  44.4 
 
 
280 aa  175  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.84 
 
 
256 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>