More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2740 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 283 aa  553  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  50.99 
 
 		 278 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.78 
 
 		 276 aa  260  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  48.62 
 
 		 280 aa  258  7e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  49.41 
 
 		 253 aa  256  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.4 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  49.21 
 
 		 271 aa  252  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  49.21 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.5 
 
 		 279 aa  245  6e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.79 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  50.79 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  52.17 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  42.86 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  47.06 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  47.04 
 
 		 255 aa  234  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  47.27 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.24 
 
 		 258 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.21 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  42.29 
 
 		 264 aa  231  9e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  47.64 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  47.24 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  50.99 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.21 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  48.22 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.9 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  48.05 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  45.95 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.64 
 
 		 259 aa  221  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  40.71 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.85 
 
 		 259 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  39.61 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  41.9 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  45.1 
 
 		 258 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.82 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  46.77 
 
 		 259 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  42.05 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  43.42 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  46.25 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.11 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  40.71 
 
 		 257 aa  205  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  42.97 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  43.36 
 
 		 263 aa  201  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  42.97 
 
 		 268 aa  199  6e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  38.04 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  43.07 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.49 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.49 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.74 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.51 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  39.45 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.17 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  40.96 
 
 		 259 aa  175  9e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  39.83 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.02 
 
 		 292 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  38.4 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  38.71 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  39.83 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  38.25 
 
 		 340 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.53 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  35.56 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  35.98 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.83 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  36.51 
 
 		 245 aa  169  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  34.3 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  38.59 
 
 		 259 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  43.55 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.9 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  40.08 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  35.89 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.4 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.87 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.52 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.92 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  39.57 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  40.25 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.24 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.15 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.68 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  34.38 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.02 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.44 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  33.74 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  36.17 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  39.27 
 
 		 252 aa  162  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.45 
 
 		 243 aa  162  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  36.48 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.38 
 
 		 222 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 		 273 aa  161  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  32.23 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  35.61 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  32.23 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  38.03 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.6 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  37.19 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.8 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  36.17 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.8 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>