More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0107 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 256 aa  533  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  67.61 
 
 		 259 aa  368  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  67.87 
 
 		 255 aa  362  2e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  62.15 
 
 		 258 aa  330  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0118  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.81 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  53.82 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.88 
 
 		 283 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.81 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  49.4 
 
 		 304 aa  258  4e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  49 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 340 aa  256  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  48.59 
 
 		 325 aa  248  8e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  46.48 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  48.24 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  44.94 
 
 		 263 aa  221  6e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  43.95 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  43.95 
 
 		 264 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.95 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  44.76 
 
 		 264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  44 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  38.91 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.34 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  38.65 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  38.55 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.06 
 
 		 251 aa  171  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  39.45 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.69 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.24 
 
 		 253 aa  169  6e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  37.08 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.69 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  38.11 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  41.1 
 
 		 251 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  39.85 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  41.1 
 
 		 251 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.92 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.2 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.2 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  39.2 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.2 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.28 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  41.35 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.2 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.2 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.2 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  40.93 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  39.2 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.2 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.3 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.17 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  40.71 
 
 		 253 aa  166  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  36.78 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.61 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  39.48 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  39.15 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  38.4 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.74 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.43 
 
 		 248 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  37.89 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.91 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  39.83 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.54 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  35.59 
 
 		 238 aa  162  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  41.63 
 
 		 254 aa  161  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.63 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  41.96 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  36.64 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  39 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  37.77 
 
 		 564 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  39.15 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.5 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.5 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  36.4 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  38.17 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.5 
 
 		 279 aa  158  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  38.17 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  38.29 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  38.55 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.48 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.48 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.82 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  37.76 
 
 		 251 aa  156  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  37.39 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.5 
 
 		 241 aa  155  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  38.3 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.92 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.7 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.97 
 
 		 249 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  36.55 
 
 		 249 aa  155  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.79 
 
 		 254 aa  155  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  38.02 
 
 		 240 aa  155  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  37.77 
 
 		 247 aa  155  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.55 
 
 		 246 aa  155  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  37.5 
 
 		 291 aa  154  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  38.02 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>