More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2063 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 255 aa  527  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  67.87 
 
 		 256 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  66.53 
 
 		 259 aa  360  1e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  61.11 
 
 		 258 aa  329  3e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0118  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.17 
 
 		 252 aa  281  6.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.79 
 
 		 292 aa  259  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  52.23 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  49.8 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  50.2 
 
 		 309 aa  252  4.0000000000000004e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 		 283 aa  251  7e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  48.4 
 
 		 318 aa  250  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  48.99 
 
 		 325 aa  245  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 264 aa  246  4e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  44.92 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  42.39 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.21 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  44.8 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  41.13 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  41.28 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  38.65 
 
 		 280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.92 
 
 		 258 aa  178  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  38.52 
 
 		 248 aa  178  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  37.65 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  39.23 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  39.76 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.84 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.48 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.48 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.22 
 
 		 279 aa  168  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.06 
 
 		 241 aa  168  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  38.26 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.04 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.55 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  37.89 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.5 
 
 		 262 aa  164  9e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.44 
 
 		 282 aa  164  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  38.82 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  37.55 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  38.04 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  36.86 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  36.82 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.6 
 
 		 252 aa  161  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.83 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  39.68 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.6 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  37.6 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.37 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  35.96 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.6 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.6 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  39.06 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.6 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.6 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.6 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  37.6 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  39.61 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  40.24 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  37.28 
 
 		 564 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.74 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  39.62 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.06 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.09 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  34.75 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.41 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.25 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.99 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 		 240 aa  158  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  38.43 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.65 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.43 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  37.27 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  37.55 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.13 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  35.59 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40498  predicted protein  37.97 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.563879  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1533  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.09 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.554505  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  38.03 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  34.62 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.23 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0348  undecaprenyl diphosphate synthase  37.77 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.55 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  37.11 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  40.79 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  37.4 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.66 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.23 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1712  undecaprenyl diphosphate synthase  35.22 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  36.84 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  37.39 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  35.86 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1777  undecaprenyl diphosphate synthase  37.77 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.12 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.74 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  37.82 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  39.85 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>