More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1319 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 238 aa  483  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0348  undecaprenyl diphosphate synthase  86.13 
 
 		 238 aa  433  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1777  undecaprenyl diphosphate synthase  83.61 
 
 		 238 aa  422  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1157  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  84.05 
 
 		 234 aa  412  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  45.53 
 
 		 268 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  41.7 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  41.03 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  40.6 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  41.6 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.89 
 
 		 264 aa  184  7e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 		 263 aa  182  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0786  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.676568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  40.76 
 
 		 278 aa  181  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.74 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.92 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.74 
 
 		 243 aa  175  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.91 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.95 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.52 
 
 		 247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  41.45 
 
 		 245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.57 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.2 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.66 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  38.91 
 
 		 257 aa  168  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  39.75 
 
 		 267 aa  168  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  38.89 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.6 
 
 		 244 aa  168  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1493  undecaprenyl diphosphate synthase  39.66 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.45 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0944  undecaprenyl diphosphate synthase  40.26 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0337161  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  40.26 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.25 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  40.26 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.89 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.33 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.24 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.83 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.75 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.6 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  40.95 
 
 		 243 aa  164  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3513  undecaprenyl diphosphate synthase  40.76 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  38.63 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.48 
 
 		 292 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  41.81 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.4 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  38.3 
 
 		 264 aa  162  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  38.36 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.5 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  37.61 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  35.59 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  38.53 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.3 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  38.2 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  36.75 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  39.32 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.22 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  40.52 
 
 		 254 aa  161  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.14 
 
 		 252 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  35.59 
 
 		 247 aa  161  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  39.21 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  37.97 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.32 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.32 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  39.42 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  38.66 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  37.87 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.15 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  39.91 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0265  undecaprenyl diphosphate synthase  40.09 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.4 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1712  undecaprenyl diphosphate synthase  36.75 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.08 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1276  undecaprenyl diphosphate synthase  38.79 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0784677  normal  0.545818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  39.15 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  39.48 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.3 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  39.42 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.91 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  39.83 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.02 
 
 		 238 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.17 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.82 
 
 		 257 aa  158  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2174  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 		 255 aa  158  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  38.63 
 
 		 251 aa  158  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  38.72 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.6 
 
 		 238 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1533  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.75 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.554505  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  38.72 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.71 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.91 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38950  undecaprenyl diphosphate synthase  37.61 
 
 		 251 aa  158  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.522438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>