More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0735 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
253 aa  525  1e-148  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.66 
 
 
258 aa  224  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.92 
 
 
257 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  48.5 
 
 
246 aa  223  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  47.41 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.38 
 
 
256 aa  218  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
251 aa  217  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  46.78 
 
 
248 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  46.78 
 
 
260 aa  216  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.64 
 
 
253 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.64 
 
 
253 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.49 
 
 
246 aa  215  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.34 
 
 
257 aa  214  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.17 
 
 
259 aa  214  9e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  43.35 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.12 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.12 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.12 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.12 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.12 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.12 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.12 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.84 
 
 
258 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  41.32 
 
 
258 aa  211  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.6 
 
 
249 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  45.92 
 
 
246 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  45.76 
 
 
244 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.35 
 
 
249 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  42.44 
 
 
249 aa  209  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.55 
 
 
258 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.55 
 
 
257 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  43.35 
 
 
247 aa  208  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
246 aa  209  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  44.64 
 
 
248 aa  208  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  42.49 
 
 
245 aa  208  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  43.1 
 
 
256 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  43.97 
 
 
240 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  42.67 
 
 
238 aa  207  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  44.64 
 
 
254 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.69 
 
 
249 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  45.65 
 
 
227 aa  206  4e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  41.13 
 
 
273 aa  206  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  43.35 
 
 
253 aa  205  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  44.4 
 
 
251 aa  205  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  44.4 
 
 
251 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.4 
 
 
259 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.49 
 
 
246 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.49 
 
 
246 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.83 
 
 
241 aa  203  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.92 
 
 
249 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.83 
 
 
252 aa  202  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.67 
 
 
267 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.44 
 
 
245 aa  202  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.53 
 
 
249 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  43.78 
 
 
260 aa  201  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.83 
 
 
260 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  42.24 
 
 
259 aa  201  6e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.1 
 
 
249 aa  201  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  42.92 
 
 
288 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.59 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3193  undecaprenyl diphosphate synthase  43.53 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  43.78 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.53 
 
 
251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  42.92 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.53 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0444  undecaprenyl diphosphate synthase  44.78 
 
 
228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00160687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  42.92 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  42.92 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.3 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.81 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  42.67 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.86 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.39 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.39 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.49 
 
 
238 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  41.35 
 
 
256 aa  199  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.13 
 
 
247 aa  199  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  42.98 
 
 
260 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  41.99 
 
 
254 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1276  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 
243 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0784677  normal  0.545818 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.16 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.78 
 
 
248 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.16 
 
 
254 aa  198  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  42.92 
 
 
260 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.22 
 
 
250 aa  198  6e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  42.92 
 
 
260 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  42.92 
 
 
260 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  42.92 
 
 
260 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  41.38 
 
 
264 aa  198  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  40.33 
 
 
282 aa  198  7e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  42.42 
 
 
254 aa  198  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.06 
 
 
261 aa  197  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.88 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.63 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.49 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2675  undecaprenyl diphosphate synthase  44.21 
 
 
242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.93656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  43.72 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>