More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0444 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0444  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
228 aa  474  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00160687  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0997  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  60.18 
 
 
225 aa  275  4e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0750  undecaprenyl diphosphate synthase  53.78 
 
 
225 aa  246  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.397744  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.42 
 
 
241 aa  244  6.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  53.12 
 
 
227 aa  243  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  50.87 
 
 
246 aa  238  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  48.7 
 
 
240 aa  234  6e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  49.35 
 
 
233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
253 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
252 aa  229  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
252 aa  229  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
252 aa  229  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  49.12 
 
 
253 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
253 aa  229  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
253 aa  229  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
240 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
253 aa  229  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  47.53 
 
 
257 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  51.56 
 
 
266 aa  228  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  47.53 
 
 
257 aa  228  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
252 aa  228  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
252 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
252 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
252 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
252 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.46 
 
 
236 aa  228  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
271 aa  228  8e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  46.19 
 
 
236 aa  227  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  48.89 
 
 
264 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.67 
 
 
252 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
252 aa  227  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0743722  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0970  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  50.22 
 
 
226 aa  227  1e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.542605  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0695  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  53.54 
 
 
223 aa  227  1e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  48.44 
 
 
263 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  48.9 
 
 
252 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
258 aa  226  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  48.89 
 
 
274 aa  224  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  49.13 
 
 
245 aa  224  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.22 
 
 
275 aa  224  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.22 
 
 
275 aa  224  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  48.44 
 
 
275 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  48.89 
 
 
275 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  48.44 
 
 
275 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
248 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  48.26 
 
 
256 aa  223  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.37 
 
 
253 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.37 
 
 
253 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  48.44 
 
 
275 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.89 
 
 
275 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.35 
 
 
251 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  48.48 
 
 
254 aa  222  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  48 
 
 
275 aa  222  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  48.92 
 
 
251 aa  221  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  48.44 
 
 
275 aa  221  8e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.44 
 
 
246 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.98 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  46.12 
 
 
255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.35 
 
 
252 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1018  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.58 
 
 
252 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000425553  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  46.98 
 
 
260 aa  219  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.58 
 
 
252 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
261 aa  219  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.58 
 
 
252 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.83 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  46.43 
 
 
236 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  48 
 
 
264 aa  218  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  47.35 
 
 
253 aa  218  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
256 aa  218  6e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
253 aa  218  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  46.36 
 
 
233 aa  218  7e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.7 
 
 
258 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.7 
 
 
257 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
249 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.67 
 
 
246 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.26 
 
 
258 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.26 
 
 
258 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.83 
 
 
254 aa  217  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.26 
 
 
258 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.26 
 
 
258 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  44.98 
 
 
232 aa  217  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.26 
 
 
258 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  45.91 
 
 
228 aa  217  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.7 
 
 
258 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.4 
 
 
255 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  48.7 
 
 
246 aa  216  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.32 
 
 
257 aa  216  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.16 
 
 
267 aa  216  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.81 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  44.93 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.81 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  45.74 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  47.56 
 
 
266 aa  215  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  45.02 
 
 
250 aa  215  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.61 
 
 
248 aa  214  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  45.7 
 
 
231 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.09 
 
 
256 aa  214  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.26 
 
 
249 aa  214  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.09 
 
 
256 aa  214  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2675  undecaprenyl diphosphate synthase  45.78 
 
 
242 aa  214  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.93656  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  46.9 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>