More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1252 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
233 aa  480  1e-135  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
228 aa  226  2e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  45.95 
 
 
255 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
243 aa  225  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.22 
 
 
256 aa  223  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.55 
 
 
241 aa  221  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.53 
 
 
248 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0444  undecaprenyl diphosphate synthase  46.36 
 
 
228 aa  218  7e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00160687  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.23 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.14 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  45.33 
 
 
245 aa  211  7.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  46.75 
 
 
244 aa  209  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.22 
 
 
257 aa  209  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.91 
 
 
249 aa  207  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  44.59 
 
 
264 aa  207  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  44.93 
 
 
261 aa  207  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  45.22 
 
 
264 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 
260 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0527  undecaprenyl diphosphate synthase  44 
 
 
231 aa  206  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 
260 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.05 
 
 
260 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3651  undecaprenyl diphosphate synthase  43.24 
 
 
251 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3725  undecaprenyl diphosphate synthase  43.24 
 
 
251 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 
260 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.69 
 
 
222 aa  206  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 
260 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  41.45 
 
 
240 aa  204  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  43.61 
 
 
260 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.29 
 
 
258 aa  204  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  43.61 
 
 
260 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.61 
 
 
258 aa  204  9e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  45.92 
 
 
240 aa  204  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.99 
 
 
247 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  42.24 
 
 
272 aa  203  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  42.54 
 
 
262 aa  203  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.18 
 
 
246 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  42.92 
 
 
244 aa  202  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  44.64 
 
 
231 aa  202  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.17 
 
 
258 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.04 
 
 
241 aa  202  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.17 
 
 
233 aa  202  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  40.79 
 
 
252 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  43.86 
 
 
246 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  44.16 
 
 
251 aa  202  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.74 
 
 
258 aa  201  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 
232 aa  201  7e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.61 
 
 
258 aa  201  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.61 
 
 
258 aa  201  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  40.69 
 
 
251 aa  201  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.61 
 
 
258 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.61 
 
 
258 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.79 
 
 
236 aa  201  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.17 
 
 
244 aa  201  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  43.29 
 
 
256 aa  201  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.85 
 
 
260 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  41.85 
 
 
236 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.16 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  41.85 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.17 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  41.81 
 
 
239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.17 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0997  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  46.26 
 
 
225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.74 
 
 
258 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.74 
 
 
257 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  40.61 
 
 
254 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  41.45 
 
 
273 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1450  undecaprenyl diphosphate synthase  43.16 
 
 
255 aa  199  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.207922  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4063  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.79 
 
 
236 aa  199  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0750  undecaprenyl diphosphate synthase  43.11 
 
 
225 aa  199  3e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.397744  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  44.09 
 
 
227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  43.42 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.86 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  42.29 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.61 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  39.57 
 
 
247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  40.77 
 
 
247 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  38.94 
 
 
241 aa  198  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  40.77 
 
 
247 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  42.17 
 
 
288 aa  198  7e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.56 
 
 
257 aa  198  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  42.36 
 
 
263 aa  197  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.43 
 
 
252 aa  197  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  42.36 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.26 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.26 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.73 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  42.15 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  42.73 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  41.81 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0970  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  42.22 
 
 
226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.542605  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  41.96 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  41.33 
 
 
236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  43.23 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  41.67 
 
 
236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  42.11 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0935  undecaprenyl diphosphate synthase  43.56 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  40.89 
 
 
236 aa  196  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  42.79 
 
 
275 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>