More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4431 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
236 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4063  undecaprenyl pyrophosphate synthase  98.73 
 
 
236 aa  453  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4545  undecaprenyl pyrophosphate synthase  89.83 
 
 
236 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  74.26 
 
 
233 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0802  undecaprenyl pyrophosphate synthase  71.86 
 
 
240 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.858671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0469  undecaprenyl pyrophosphate synthase  71.67 
 
 
238 aa  297  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7856  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.75 
 
 
247 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.855408  normal  0.187667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0061  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.37 
 
 
245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3136  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.01 
 
 
256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.898885  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2688  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.02 
 
 
239 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.35 
 
 
244 aa  234  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  51.3 
 
 
254 aa  217  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.95 
 
 
245 aa  214  7e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.1 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  45.58 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  51.08 
 
 
254 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.05 
 
 
249 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1227  undecaprenyl diphosphate synthase  51.83 
 
 
244 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0880446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
264 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
249 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2581  undecaprenyl diphosphate synthase  51.83 
 
 
244 aa  209  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.181567  normal  0.0357168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  48.44 
 
 
264 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  47.84 
 
 
259 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.5 
 
 
249 aa  208  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.56 
 
 
266 aa  207  9e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
252 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2603  undecaprenyl diphosphate synthase  48.87 
 
 
247 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.54 
 
 
259 aa  206  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
222 aa  205  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.67 
 
 
257 aa  204  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
260 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
260 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
260 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  41.23 
 
 
228 aa  204  8e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.51 
 
 
260 aa  204  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.46 
 
 
252 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.56 
 
 
275 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  47.56 
 
 
266 aa  202  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  48.09 
 
 
260 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.12 
 
 
259 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  48.09 
 
 
260 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.54 
 
 
251 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  47.11 
 
 
264 aa  202  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.17 
 
 
253 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.17 
 
 
253 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
260 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
252 aa  202  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  46.05 
 
 
256 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  48.67 
 
 
251 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  47.56 
 
 
263 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.02 
 
 
252 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.94 
 
 
254 aa  202  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  48.67 
 
 
251 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  48.67 
 
 
251 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  46.15 
 
 
257 aa  201  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.02 
 
 
252 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.12 
 
 
251 aa  201  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  45.37 
 
 
257 aa  201  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  42.79 
 
 
233 aa  201  9e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  49.08 
 
 
248 aa  201  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0970  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  44.09 
 
 
226 aa  201  9e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.542605  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  48.23 
 
 
251 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.32 
 
 
253 aa  200  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.33 
 
 
267 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.23 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  48.4 
 
 
255 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.11 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.11 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1762  undecaprenyl diphosphate synthase  46.29 
 
 
240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.430712  normal  0.0678846 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.51 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.33 
 
 
246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  48.65 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  43.84 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  46.4 
 
 
265 aa  199  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  46.64 
 
 
234 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.67 
 
 
251 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.96 
 
 
251 aa  199  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.75 
 
 
243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.21 
 
 
267 aa  198  5e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  48.23 
 
 
251 aa  198  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.23 
 
 
251 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
260 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
260 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 
275 aa  198  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  45.81 
 
 
247 aa  198  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  45.06 
 
 
257 aa  198  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1450  undecaprenyl diphosphate synthase  47.16 
 
 
255 aa  198  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.207922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
260 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.11 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.58 
 
 
252 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3651  undecaprenyl diphosphate synthase  50.45 
 
 
251 aa  197  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3725  undecaprenyl diphosphate synthase  50.45 
 
 
251 aa  197  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  44.89 
 
 
240 aa  197  9e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.23 
 
 
236 aa  197  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.16 
 
 
265 aa  197  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.89 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.12 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2691  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.51 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  0.513903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>