More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0802 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0802  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
240 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.858671 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4063  undecaprenyl pyrophosphate synthase  72.29 
 
 
236 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  71.86 
 
 
236 aa  318  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  72.29 
 
 
233 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4545  undecaprenyl pyrophosphate synthase  71 
 
 
236 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0469  undecaprenyl pyrophosphate synthase  67.21 
 
 
238 aa  290  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7856  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.58 
 
 
247 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.855408  normal  0.187667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0061  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.49 
 
 
245 aa  277  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2688  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.91 
 
 
239 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3136  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.2 
 
 
256 aa  248  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.898885  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.79 
 
 
244 aa  222  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  50.65 
 
 
254 aa  218  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2603  undecaprenyl diphosphate synthase  48.09 
 
 
247 aa  214  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  50.64 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1227  undecaprenyl diphosphate synthase  51.54 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0880446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2581  undecaprenyl diphosphate synthase  51.54 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.181567  normal  0.0357168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1827  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.44 
 
 
247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.35 
 
 
249 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  48.56 
 
 
260 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.67 
 
 
245 aa  209  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.84 
 
 
252 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
251 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.84 
 
 
252 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1762  undecaprenyl diphosphate synthase  47.96 
 
 
240 aa  208  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.430712  normal  0.0678846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.15 
 
 
260 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.98 
 
 
258 aa  207  9e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.89 
 
 
252 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2691  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.44 
 
 
246 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  43.67 
 
 
240 aa  206  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.84 
 
 
252 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.05 
 
 
256 aa  205  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.05 
 
 
256 aa  205  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.67 
 
 
249 aa  204  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  46.05 
 
 
256 aa  204  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  46.49 
 
 
253 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.61 
 
 
256 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  44.1 
 
 
240 aa  204  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.16 
 
 
253 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  44.74 
 
 
264 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 
260 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  45.31 
 
 
251 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  46.06 
 
 
254 aa  202  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.32 
 
 
237 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  46.5 
 
 
260 aa  201  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.44 
 
 
251 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  44.74 
 
 
266 aa  201  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  44.64 
 
 
263 aa  201  9e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.84 
 
 
260 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.98 
 
 
252 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  46.84 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  44.59 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  46.84 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  46.84 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.19 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.04 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.93 
 
 
265 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  47.14 
 
 
255 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  46.86 
 
 
264 aa  199  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.64 
 
 
251 aa  199  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  47.21 
 
 
251 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0970  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  42.6 
 
 
226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.542605  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.98 
 
 
243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  44.35 
 
 
257 aa  198  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1408  undecaprenyl pyrophosphate synthetase protein  45.57 
 
 
258 aa  198  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  47.28 
 
 
258 aa  198  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  45.99 
 
 
260 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  45.99 
 
 
260 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.49 
 
 
259 aa  197  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
260 aa  197  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  43.86 
 
 
264 aa  197  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  46.26 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  44.54 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  47.56 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.74 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  43.53 
 
 
266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  46.86 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  42.08 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  45.61 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  40.62 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.99 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  43.83 
 
 
271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0750  undecaprenyl diphosphate synthase  42.15 
 
 
225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.397744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 
256 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  45.02 
 
 
247 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.22 
 
 
251 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  46.55 
 
 
257 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 
236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  44.89 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  44.89 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  44.89 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.22 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  44.59 
 
 
247 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  47.11 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
254 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  47.11 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3725  undecaprenyl diphosphate synthase  48.67 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3651  undecaprenyl diphosphate synthase  48.67 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.89 
 
 
275 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.89 
 
 
275 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3995  undecaprenyl diphosphate synthase  46.7 
 
 
244 aa  195  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.699417  normal  0.221375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>