More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3136 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3136  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.898885  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.01 
 
 
236 aa  268  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4063  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.14 
 
 
236 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0469  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.04 
 
 
238 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.91 
 
 
233 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7856  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.88 
 
 
247 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.855408  normal  0.187667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4545  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.5 
 
 
236 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0802  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.2 
 
 
240 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.858671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0061  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.65 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2688  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.7 
 
 
239 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.26 
 
 
237 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.84 
 
 
254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
254 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  46.81 
 
 
247 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.19 
 
 
245 aa  209  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
255 aa  208  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.61 
 
 
244 aa  208  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  45.96 
 
 
247 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2603  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
247 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.38 
 
 
251 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.58 
 
 
247 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  47.58 
 
 
247 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
252 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  41.99 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.85 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  45.06 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  44.78 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.57 
 
 
252 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.15 
 
 
252 aa  198  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.39 
 
 
252 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.73 
 
 
258 aa  198  7e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  43.5 
 
 
236 aa  198  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  43.95 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  47.11 
 
 
262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  41.63 
 
 
246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1450  undecaprenyl diphosphate synthase  45.15 
 
 
255 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.207922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  47.09 
 
 
248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.86 
 
 
248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  46.15 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  41.92 
 
 
233 aa  195  5.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2691  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.58 
 
 
246 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  47.56 
 
 
250 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
267 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.98 
 
 
246 aa  194  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  45.04 
 
 
266 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  40.09 
 
 
228 aa  193  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2151  undecaprenyl diphosphate synthase  44.49 
 
 
245 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  41.95 
 
 
236 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.26 
 
 
259 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.67 
 
 
266 aa  192  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  44.74 
 
 
255 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.61 
 
 
249 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 
256 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.22 
 
 
257 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  43.3 
 
 
244 aa  192  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.51 
 
 
252 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.23 
 
 
249 aa  191  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  44.89 
 
 
241 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  40.97 
 
 
249 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  46.29 
 
 
252 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.04 
 
 
241 aa  190  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  45.25 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  42.42 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  43.53 
 
 
243 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3725  undecaprenyl diphosphate synthase  45.18 
 
 
251 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3651  undecaprenyl diphosphate synthase  45.18 
 
 
251 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.15 
 
 
243 aa  189  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  44.84 
 
 
255 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44 
 
 
251 aa  188  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.5 
 
 
253 aa  188  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1541  undecaprenyl diphosphate synthase  42.54 
 
 
237 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1762  undecaprenyl diphosphate synthase  46.4 
 
 
240 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.430712  normal  0.0678846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0612  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.54 
 
 
237 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.13 
 
 
249 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  41.41 
 
 
251 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  45.33 
 
 
264 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.05 
 
 
253 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 
252 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  40.91 
 
 
227 aa  187  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.05 
 
 
253 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  45.78 
 
 
266 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  47.83 
 
 
254 aa  186  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  44.05 
 
 
253 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  43.11 
 
 
261 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.05 
 
 
253 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.05 
 
 
252 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.33 
 
 
249 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  41.78 
 
 
234 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0970  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  41.26 
 
 
226 aa  187  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.542605  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  39.34 
 
 
256 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.05 
 
 
252 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.05 
 
 
253 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.7 
 
 
267 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  38.67 
 
 
245 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  42.92 
 
 
244 aa  186  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.79 
 
 
267 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1945  undecaprenyl diphosphate synthase  42.6 
 
 
231 aa  186  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.77987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>