More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2691 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2691  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1762  undecaprenyl diphosphate synthase  78.81 
 
 		 240 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.430712  normal  0.0678846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  75.77 
 
 		 248 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2603  undecaprenyl diphosphate synthase  69.96 
 
 		 247 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1827  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  73.93 
 
 		 247 aa  360  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1227  undecaprenyl diphosphate synthase  69.62 
 
 		 244 aa  349  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0880446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2581  undecaprenyl diphosphate synthase  69.2 
 
 		 244 aa  348  5e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.181567  normal  0.0357168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1442  undecaprenyl diphosphate synthase  72.65 
 
 		 243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2846  undecaprenyl diphosphate synthase  57.2 
 
 		 257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0789  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.35 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.122515 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1975  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.71 
 
 		 258 aa  268  8e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.100938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  53.14 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.5 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1408  undecaprenyl pyrophosphate synthetase protein  55.17 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  52.52 
 
 		 260 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  51.93 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  51.88 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.11 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.42 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  52.3 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  52.3 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  51.25 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  52.52 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.08 
 
 		 260 aa  262  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  52.08 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  52.52 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  52.08 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  52.08 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  52.52 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.46 
 
 		 260 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  52.1 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  54.31 
 
 		 258 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  52.1 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  52.1 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  52.1 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  53.88 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.61 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  53.85 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  52.92 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  54.01 
 
 		 262 aa  255  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  51.5 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.2 
 
 		 251 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  52.5 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  52.97 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  52.5 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.72 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  52.99 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  52.48 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  51.87 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  51.85 
 
 		 264 aa  250  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  51.26 
 
 		 254 aa  250  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2174  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.65 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.21 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  52.3 
 
 		 271 aa  248  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.95 
 
 		 250 aa  248  6e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.28 
 
 		 275 aa  248  7e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.28 
 
 		 275 aa  248  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  52.56 
 
 		 266 aa  248  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  52.56 
 
 		 266 aa  248  9e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  51.71 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  51.45 
 
 		 275 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  51.45 
 
 		 275 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  51.45 
 
 		 275 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  51.87 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.73 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  51.45 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.87 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.15 
 
 		 255 aa  245  6e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  48.73 
 
 		 257 aa  242  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  50.84 
 
 		 261 aa  242  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  51.71 
 
 		 274 aa  242  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.74 
 
 		 255 aa  241  5e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 		 251 aa  241  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  51.04 
 
 		 275 aa  241  6e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3193  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 250 aa  241  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  51.25 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  52.36 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  48.1 
 
 		 256 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2675  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 		 242 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.93656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.41 
 
 		 257 aa  238  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.56 
 
 		 257 aa  238  9e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38950  undecaprenyl diphosphate synthase  50.2 
 
 		 251 aa  235  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.522438  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  47.11 
 
 		 268 aa  235  6e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.58 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.75 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  48.31 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2972  undecaprenyl diphosphate synthase  49.14 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.906819 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 253 aa  229  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  46.84 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  47.23 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  44.96 
 
 		 291 aa  227  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  46.38 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 		 254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.3 
 
 		 285 aa  224  7e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>