More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1975 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1975  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
258 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.100938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2846  undecaprenyl diphosphate synthase  72.69 
 
 
257 aa  356  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  58.01 
 
 
248 aa  295  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1762  undecaprenyl diphosphate synthase  61.16 
 
 
240 aa  294  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.430712  normal  0.0678846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1827  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.91 
 
 
247 aa  289  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2691  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.25 
 
 
246 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2603  undecaprenyl diphosphate synthase  57.14 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1227  undecaprenyl diphosphate synthase  57.52 
 
 
244 aa  278  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0880446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2581  undecaprenyl diphosphate synthase  57.08 
 
 
244 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.181567  normal  0.0357168 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  54.87 
 
 
265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  57.89 
 
 
258 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  52.4 
 
 
260 aa  271  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.52 
 
 
253 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  57.46 
 
 
258 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  53.28 
 
 
260 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.65 
 
 
256 aa  268  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.4 
 
 
260 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.1 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  52.4 
 
 
260 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  53.28 
 
 
260 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  53.28 
 
 
260 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  52.4 
 
 
260 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  52.4 
 
 
260 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  52.4 
 
 
260 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.42 
 
 
260 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  50.88 
 
 
244 aa  263  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  53.07 
 
 
260 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2675  undecaprenyl diphosphate synthase  51.07 
 
 
242 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.93656  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  53.07 
 
 
260 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  53.07 
 
 
260 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  51.97 
 
 
260 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  51.97 
 
 
260 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  51.97 
 
 
260 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  51.97 
 
 
260 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  52.63 
 
 
260 aa  261  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1408  undecaprenyl pyrophosphate synthetase protein  53.95 
 
 
258 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0789  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.14 
 
 
245 aa  260  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.122515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  55.02 
 
 
262 aa  260  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  50.88 
 
 
257 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  51.75 
 
 
257 aa  256  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2174  undecaprenyl diphosphate synthase  50.83 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3193  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
250 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1442  undecaprenyl diphosphate synthase  56.39 
 
 
243 aa  245  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.23732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.79 
 
 
251 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  50.62 
 
 
261 aa  244  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  50 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.79 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
233 aa  242  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.21 
 
 
252 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
252 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
252 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
252 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
252 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
238 aa  240  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
238 aa  240  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  48.98 
 
 
253 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
253 aa  239  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  47.37 
 
 
236 aa  238  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  49.78 
 
 
266 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.93 
 
 
257 aa  236  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.38 
 
 
252 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
252 aa  236  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.5 
 
 
248 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.91 
 
 
255 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
253 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 
254 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  46.91 
 
 
256 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  44.54 
 
 
239 aa  236  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
253 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
253 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
253 aa  236  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  49.36 
 
 
253 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
252 aa  235  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
252 aa  235  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
252 aa  235  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  41.77 
 
 
236 aa  236  4e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
271 aa  235  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
263 aa  236  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 
252 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  43.56 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.3 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.3 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.26 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  48.71 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  47.86 
 
 
251 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.72 
 
 
237 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  48.71 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  48.71 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  48.48 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.16 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.1 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0743722  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  46.05 
 
 
272 aa  232  5e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.66 
 
 
248 aa  232  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  48.09 
 
 
247 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  44 
 
 
236 aa  231  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.05 
 
 
251 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>