More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0469 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0469  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
238 aa  461  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  84.94 
 
 
233 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  71.9 
 
 
236 aa  316  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4063  undecaprenyl pyrophosphate synthase  71.9 
 
 
236 aa  315  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0802  undecaprenyl pyrophosphate synthase  69.26 
 
 
240 aa  298  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.858671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7856  undecaprenyl pyrophosphate synthase  69.57 
 
 
247 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.855408  normal  0.187667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0061  undecaprenyl pyrophosphate synthase  69.1 
 
 
245 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4545  undecaprenyl pyrophosphate synthase  72.22 
 
 
236 aa  289  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3136  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.04 
 
 
256 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.898885  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2688  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.98 
 
 
239 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.93 
 
 
244 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  54.67 
 
 
254 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.98 
 
 
245 aa  220  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  47.13 
 
 
259 aa  217  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.36 
 
 
237 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  50.89 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.23 
 
 
247 aa  211  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  48.25 
 
 
264 aa  211  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 
255 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.1 
 
 
254 aa  210  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.9 
 
 
252 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
252 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.1 
 
 
254 aa  210  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.06 
 
 
252 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.89 
 
 
249 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.67 
 
 
249 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
254 aa  209  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.93 
 
 
257 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.9 
 
 
252 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  41.82 
 
 
227 aa  209  4e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
247 aa  207  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.34 
 
 
259 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
252 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  45.89 
 
 
261 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.48 
 
 
251 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
250 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  47.16 
 
 
263 aa  206  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
247 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  47.16 
 
 
228 aa  204  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  42.36 
 
 
240 aa  204  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
266 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 
282 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  53.1 
 
 
254 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.72 
 
 
257 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  46.05 
 
 
264 aa  202  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.6 
 
 
266 aa  202  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.2 
 
 
253 aa  202  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  44.74 
 
 
256 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.33 
 
 
256 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.9 
 
 
251 aa  201  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.11 
 
 
249 aa  201  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.29 
 
 
253 aa  201  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.29 
 
 
253 aa  201  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.14 
 
 
251 aa  201  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.61 
 
 
267 aa  201  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.92 
 
 
258 aa  201  9e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.7 
 
 
252 aa  200  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.33 
 
 
246 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.89 
 
 
251 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2603  undecaprenyl diphosphate synthase  49.09 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1227  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0880446  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.38 
 
 
248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.21 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.46 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  43.56 
 
 
240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2581  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
244 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.181567  normal  0.0357168 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  46.05 
 
 
238 aa  199  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.86 
 
 
267 aa  199  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1827  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.43 
 
 
247 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.35 
 
 
243 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  42.92 
 
 
231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  44.4 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0444  undecaprenyl diphosphate synthase  43.24 
 
 
228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00160687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  42.98 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.29 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.29 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  46.35 
 
 
255 aa  198  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2593  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.66 
 
 
249 aa  198  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0126809  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  47.11 
 
 
252 aa  198  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  45.29 
 
 
236 aa  198  7e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  44.89 
 
 
276 aa  197  7.999999999999999e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.37 
 
 
246 aa  197  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  42.54 
 
 
246 aa  197  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  41.07 
 
 
233 aa  197  9e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2151  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  45.41 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  45.41 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  45.41 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.22 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  45.41 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  43.05 
 
 
244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.93 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  43.53 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  49.32 
 
 
248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  45.41 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>