More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7856 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7856  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
247 aa  487  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.855408  normal  0.187667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0061  undecaprenyl pyrophosphate synthase  76.13 
 
 
245 aa  345  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2688  undecaprenyl pyrophosphate synthase  71.13 
 
 
239 aa  321  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.75 
 
 
236 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4063  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.93 
 
 
236 aa  280  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.53 
 
 
233 aa  278  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0802  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.58 
 
 
240 aa  276  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.858671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0469  undecaprenyl pyrophosphate synthase  68.7 
 
 
238 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4545  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.98 
 
 
236 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3136  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.88 
 
 
256 aa  249  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.898885  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.07 
 
 
244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.43 
 
 
245 aa  217  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.65 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  47.14 
 
 
240 aa  209  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.81 
 
 
258 aa  208  5e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.65 
 
 
255 aa  207  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  47.79 
 
 
253 aa  207  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  45.98 
 
 
236 aa  207  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
254 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2603  undecaprenyl diphosphate synthase  49.33 
 
 
247 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.92 
 
 
247 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
254 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0567  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.56 
 
 
252 aa  205  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 
252 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.46 
 
 
246 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.86 
 
 
253 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.86 
 
 
253 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
247 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  43.19 
 
 
247 aa  202  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.47 
 
 
252 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0743722  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
254 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
264 aa  202  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  46.55 
 
 
259 aa  201  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.91 
 
 
252 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  43.48 
 
 
240 aa  201  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  43.23 
 
 
249 aa  201  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  47.5 
 
 
255 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  46.9 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  44.17 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  47.81 
 
 
250 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.3 
 
 
241 aa  199  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.31 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.81 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  49.09 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  43.86 
 
 
246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.56 
 
 
249 aa  198  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.58 
 
 
256 aa  198  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  45.18 
 
 
257 aa  198  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  42.22 
 
 
246 aa  198  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  42.15 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1827  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.79 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.901337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.14 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0265  undecaprenyl diphosphate synthase  44.21 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  45.58 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  43.75 
 
 
236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  43.3 
 
 
236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.34 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  44.3 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1227  undecaprenyl diphosphate synthase  47.71 
 
 
244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0880446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.89 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2691  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.1 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.21 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
253 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 
252 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
252 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
253 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.43 
 
 
256 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.43 
 
 
256 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
252 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  48.89 
 
 
260 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
253 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  47.6 
 
 
253 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
253 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  45.34 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  46.64 
 
 
248 aa  195  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  41.41 
 
 
245 aa  195  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  44.98 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  43.95 
 
 
243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2581  undecaprenyl diphosphate synthase  47.25 
 
 
244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.181567  normal  0.0357168 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  44.58 
 
 
254 aa  195  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.34 
 
 
251 aa  195  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  45.13 
 
 
245 aa  194  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  44.69 
 
 
264 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0486  undecaprenyl diphosphate synthase  47.58 
 
 
294 aa  194  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  46.49 
 
 
254 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.22 
 
 
260 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  48.23 
 
 
253 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  44.83 
 
 
259 aa  194  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.5 
 
 
251 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.02 
 
 
266 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  46.38 
 
 
266 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  48.7 
 
 
260 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.16 
 
 
252 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.16 
 
 
252 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.16 
 
 
252 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>