More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0118 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0118  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
252 aa  528  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  53.6 
 
 
259 aa  287  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  51.81 
 
 
256 aa  280  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  53.6 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  50.2 
 
 
258 aa  265  8e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.09 
 
 
292 aa  236  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.16 
 
 
283 aa  229  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  44.18 
 
 
318 aa  226  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  44.94 
 
 
309 aa  226  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  44.76 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  42.57 
 
 
325 aa  217  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  44.53 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  40.52 
 
 
263 aa  190  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  41.74 
 
 
258 aa  187  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  42.36 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  38.91 
 
 
268 aa  179  4e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 
264 aa  178  8e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.86 
 
 
264 aa  175  6e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 
264 aa  168  9e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  40.35 
 
 
264 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  35.32 
 
 
263 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  36.48 
 
 
280 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.84 
 
 
258 aa  157  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  35.62 
 
 
278 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  36.72 
 
 
257 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.34 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  36.48 
 
 
245 aa  152  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.39 
 
 
249 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.34 
 
 
233 aa  151  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  35.22 
 
 
264 aa  150  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.64 
 
 
252 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0743722  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  37.93 
 
 
238 aa  150  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.09 
 
 
252 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  37.12 
 
 
256 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  36.52 
 
 
564 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.16 
 
 
253 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.16 
 
 
253 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.96 
 
 
253 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  36.96 
 
 
252 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.96 
 
 
253 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.96 
 
 
253 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.68 
 
 
247 aa  149  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.84 
 
 
251 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  35.25 
 
 
257 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.96 
 
 
252 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  36.96 
 
 
253 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  36.4 
 
 
251 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.96 
 
 
253 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.96 
 
 
252 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  36.77 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  33.86 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  37.07 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  35.59 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  36.77 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.96 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.96 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.96 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.27 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.96 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.96 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.96 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  35.41 
 
 
281 aa  146  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  35.29 
 
 
275 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  35.21 
 
 
271 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  32.94 
 
 
263 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  33.89 
 
 
257 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  34.29 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.87 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  35.53 
 
 
254 aa  145  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  32.94 
 
 
262 aa  145  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.96 
 
 
252 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  33.33 
 
 
291 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1777  undecaprenyl diphosphate synthase  35.78 
 
 
238 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  36.12 
 
 
252 aa  144  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  34.63 
 
 
259 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0567  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.03 
 
 
252 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.87 
 
 
275 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.87 
 
 
275 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  35.09 
 
 
248 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  37.23 
 
 
239 aa  143  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.8 
 
 
244 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29164  cis-prenyltransferase involved in dolichol synthesis  37.17 
 
 
318 aa  143  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225728  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  32.49 
 
 
246 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  36.64 
 
 
273 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  35.78 
 
 
252 aa  142  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  32.54 
 
 
263 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  32.54 
 
 
263 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0348  undecaprenyl diphosphate synthase  34.91 
 
 
238 aa  142  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.2 
 
 
241 aa  141  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  34.63 
 
 
256 aa  141  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  31.47 
 
 
262 aa  141  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.83 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  31.62 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  33.07 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  33.76 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.21 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.21 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40498  predicted protein  34.57 
 
 
311 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.563879  normal  0.541352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>