More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3250 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 318 aa  640    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  76 
 
 		 325 aa  465  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  66.99 
 
 		 309 aa  426  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  69.23 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  64.51 
 
 		 304 aa  368  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  50.2 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  49.59 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  49 
 
 		 256 aa  256  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.27 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  49.39 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  48.4 
 
 		 255 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.95 
 
 		 283 aa  242  7e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  44.63 
 
 		 263 aa  230  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0118  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.18 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  45.34 
 
 		 258 aa  225  7e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  42.54 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  45.91 
 
 		 268 aa  212  7e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  40.35 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.5 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  40.91 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.81 
 
 		 243 aa  183  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  37.28 
 
 		 263 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  38.11 
 
 		 278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  36.65 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  41.41 
 
 		 247 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  36.28 
 
 		 282 aa  176  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.4 
 
 		 258 aa  176  6e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  37.61 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.65 
 
 		 258 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  35.74 
 
 		 239 aa  172  5.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  36.21 
 
 		 272 aa  172  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.56 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.56 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  38.5 
 
 		 291 aa  170  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.58 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.73 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.61 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  36.73 
 
 		 276 aa  169  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.86 
 
 		 252 aa  169  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  36.8 
 
 		 240 aa  168  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  35.37 
 
 		 246 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.41 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  36.36 
 
 		 253 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  38.62 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  36.6 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.37 
 
 		 254 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  36.09 
 
 		 248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  36.28 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  38.77 
 
 		 264 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  38.34 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  38.7 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  38.03 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.61 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  32.6 
 
 		 267 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  34.07 
 
 		 285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  37.89 
 
 		 266 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  38.6 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  36.8 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  38.05 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  36.78 
 
 		 255 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  31.3 
 
 		 267 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.5 
 
 		 253 aa  162  9e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.21 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  36.28 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.61 
 
 		 252 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  32.6 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.61 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  36.61 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  33.98 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  34.07 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.61 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  35.84 
 
 		 264 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  35.37 
 
 		 256 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.61 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  36.61 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.61 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.61 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.61 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  38.17 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.65 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  36.91 
 
 		 564 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.5 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  36.52 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.39 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  37.99 
 
 		 245 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.5 
 
 		 251 aa  159  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  35.4 
 
 		 271 aa  159  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.19 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  36.32 
 
 		 249 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  36.8 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.17 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  34.96 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  34.71 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  35.68 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.84 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.84 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 259 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0911  undecaprenyl diphosphate synthase  36.4 
 
 		 222 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.220596  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 259 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>