More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1548 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  68.85 
 
 		 309 aa  427  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  66.08 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  64.51 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  64.54 
 
 		 325 aa  352  4e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  49.4 
 
 		 256 aa  259  4e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.89 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  50.81 
 
 		 264 aa  256  5e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  51.63 
 
 		 259 aa  250  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  49.8 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  48.35 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  47.64 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  46.43 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.73 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0118  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.76 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  41.87 
 
 		 264 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  42.54 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.46 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  41.32 
 
 		 263 aa  201  9e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  42.68 
 
 		 264 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  38.52 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.53 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  38.11 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.98 
 
 		 276 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  39.18 
 
 		 273 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.62 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  37.61 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.28 
 
 		 254 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  40.27 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.283894 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  34.68 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  40.16 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.65 
 
 		 258 aa  169  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.02 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  38.05 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  36.82 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.82 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  40.09 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.71 
 
 		 259 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  35.53 
 
 		 276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  38.43 
 
 		 255 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  35.84 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  38.21 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.65 
 
 		 247 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  38.28 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.18 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  34.87 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  34.47 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  40.39 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.65 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.65 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  38.5 
 
 		 247 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  37.4 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  36.75 
 
 		 249 aa  159  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  35.42 
 
 		 246 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.05 
 
 		 257 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 253 aa  159  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  33.86 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  38.43 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.93 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.28 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  38.04 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 256 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.17 
 
 		 246 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.53 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.61 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  31.72 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.18 
 
 		 249 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  31.72 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.05 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  37.25 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  34.96 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  36.25 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  33.63 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.47 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  35.4 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  34.03 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.51 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.51 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  37.96 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.73 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.04 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  34.5 
 
 		 261 aa  153  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.6 
 
 		 249 aa  153  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.37 
 
 		 249 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  34.51 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  37.29 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  37.24 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.25 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  34.35 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.02 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.17 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  34.87 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  37.55 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.3 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  38.52 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  35.86 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.94 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>