More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0233 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
264 aa  547  1e-155  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  90.53 
 
 
264 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  91.29 
 
 
264 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  78.79 
 
 
264 aa  447  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  62.6 
 
 
263 aa  362  3e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  55.6 
 
 
258 aa  293  1e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  48.61 
 
 
263 aa  264  1e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  45.6 
 
 
280 aa  248  9e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  45.6 
 
 
278 aa  244  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.22 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  45.06 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.9 
 
 
292 aa  233  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  42.47 
 
 
257 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  41.9 
 
 
283 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.56 
 
 
258 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  41.27 
 
 
253 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  44.08 
 
 
264 aa  223  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.27 
 
 
257 aa  222  4e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.54 
 
 
258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.72 
 
 
283 aa  221  8e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  42.45 
 
 
340 aa  219  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.8 
 
 
279 aa  219  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  40.48 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  43.95 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  40.8 
 
 
257 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  43.32 
 
 
309 aa  216  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  41.43 
 
 
257 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.11 
 
 
254 aa  215  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  40.78 
 
 
255 aa  215  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  41.5 
 
 
253 aa  214  8e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  40.39 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  40.62 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.39 
 
 
259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  41.34 
 
 
255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.04 
 
 
251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  40.48 
 
 
256 aa  211  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  45.8 
 
 
248 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40 
 
 
262 aa  211  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  40.24 
 
 
253 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40 
 
 
253 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.5 
 
 
249 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  42.34 
 
 
263 aa  208  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  45.22 
 
 
258 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  41.43 
 
 
259 aa  207  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  41.46 
 
 
304 aa  206  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.24 
 
 
252 aa  206  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  37.85 
 
 
259 aa  205  6e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  39.84 
 
 
325 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  38.58 
 
 
259 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  40.5 
 
 
318 aa  203  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  42.97 
 
 
264 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  40.48 
 
 
256 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  43.5 
 
 
246 aa  203  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  42.57 
 
 
253 aa  201  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  42.08 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.44 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  38.74 
 
 
256 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  39.84 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  39.45 
 
 
263 aa  198  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  43.33 
 
 
246 aa  198  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  40.62 
 
 
256 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.67 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.67 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.09 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  41.77 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.94 
 
 
249 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.08 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  40.59 
 
 
282 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  38.49 
 
 
253 aa  195  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.31 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  39.53 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  42.17 
 
 
266 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  43.21 
 
 
255 aa  195  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 
233 aa  195  7e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.28 
 
 
257 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  45.38 
 
 
245 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  40.77 
 
 
247 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.83 
 
 
259 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.22 
 
 
249 aa  194  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  41.35 
 
 
276 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  38.67 
 
 
262 aa  193  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  37.69 
 
 
281 aa  192  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0979  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.69 
 
 
254 aa  192  6e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00602167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.92 
 
 
256 aa  192  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  40.64 
 
 
249 aa  191  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.8 
 
 
249 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.28 
 
 
258 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  42.5 
 
 
244 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.55 
 
 
267 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  40.73 
 
 
262 aa  190  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.17 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  40.66 
 
 
276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  40.57 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.6 
 
 
249 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  41.15 
 
 
255 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  40.47 
 
 
288 aa  189  5e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  39.48 
 
 
268 aa  189  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 
248 aa  189  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.49 
 
 
263 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41 
 
 
246 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>