More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1056 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 		 258 aa  519  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.44 
 
 		 279 aa  358  4e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  66.67 
 
 		 257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  66.14 
 
 		 253 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  64.96 
 
 		 271 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  63.04 
 
 		 257 aa  332  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.75 
 
 		 262 aa  330  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  64.43 
 
 		 253 aa  328  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  62.8 
 
 		 259 aa  325  5e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.78 
 
 		 251 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.29 
 
 		 254 aa  322  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  63.92 
 
 		 255 aa  321  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  64.29 
 
 		 253 aa  321  9.000000000000001e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  64.68 
 
 		 259 aa  319  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  62.85 
 
 		 259 aa  313  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  66.67 
 
 		 253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  63.24 
 
 		 256 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  62.6 
 
 		 253 aa  308  8e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.6 
 
 		 259 aa  306  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62 
 
 		 257 aa  304  8.000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  60.32 
 
 		 255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  62.45 
 
 		 256 aa  301  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  59.84 
 
 		 256 aa  295  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  57.26 
 
 		 257 aa  291  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.85 
 
 		 253 aa  288  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  57.14 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  57.85 
 
 		 281 aa  271  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  55.91 
 
 		 262 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.21 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  53.7 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  53.7 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.37 
 
 		 259 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  51.56 
 
 		 258 aa  255  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  49.42 
 
 		 278 aa  254  8e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  49.8 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.2 
 
 		 276 aa  244  8e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.07 
 
 		 263 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.07 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  43.08 
 
 		 263 aa  238  8e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.76 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  39.62 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  47.24 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.56 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  40.16 
 
 		 264 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  40.77 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  40.56 
 
 		 264 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  43.56 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  38.34 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.22 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.77 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.87 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.87 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.5 
 
 		 249 aa  185  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.06 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  36.93 
 
 		 246 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  41.5 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.07 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  41.2 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.2 
 
 		 258 aa  181  7e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  39.13 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  40.08 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  38.36 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  35.42 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  36.44 
 
 		 263 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  37.64 
 
 		 262 aa  178  8e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.51 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  38.28 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  38.66 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  36.91 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  40.33 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0527  undecaprenyl diphosphate synthase  36.25 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  38.49 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0979  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.08 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00602167  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  37.65 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.29 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  36.02 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  37.77 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.93 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  36.05 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  35.17 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 		 256 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.41 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.61 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.61 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  40.52 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  34.75 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.33 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.87 
 
 		 243 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.92 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  38.65 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.08 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  37.69 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  35.19 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  38.52 
 
 		 249 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  37.34 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  37.82 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  35.59 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  38.67 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.82 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>