More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0809 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
256 aa  524  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  96.88 
 
 
256 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  69.92 
 
 
256 aa  387  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  65.62 
 
 
253 aa  343  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  66.01 
 
 
271 aa  341  5e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  65.61 
 
 
259 aa  331  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  65.87 
 
 
259 aa  330  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  62.35 
 
 
255 aa  327  9e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.35 
 
 
259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  64.59 
 
 
255 aa  325  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.24 
 
 
254 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  63.14 
 
 
253 aa  318  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.82 
 
 
279 aa  315  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.24 
 
 
258 aa  312  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  62.55 
 
 
257 aa  312  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  62.75 
 
 
257 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.36 
 
 
251 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  61.57 
 
 
253 aa  297  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  57.25 
 
 
253 aa  296  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  54.47 
 
 
258 aa  292  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  56.13 
 
 
260 aa  292  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  58.43 
 
 
253 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  56.25 
 
 
259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  57.31 
 
 
281 aa  281  8.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.31 
 
 
262 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.91 
 
 
257 aa  278  8e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.79 
 
 
259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  52.16 
 
 
263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  51.76 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  51.37 
 
 
262 aa  259  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  52.99 
 
 
257 aa  258  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.76 
 
 
253 aa  255  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.05 
 
 
263 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.64 
 
 
263 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51 
 
 
252 aa  246  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.3 
 
 
246 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  46.51 
 
 
278 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 
280 aa  231  7.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 
283 aa  228  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.47 
 
 
276 aa  227  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  42.02 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  40.39 
 
 
263 aa  216  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  41.11 
 
 
264 aa  215  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  40.32 
 
 
264 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.48 
 
 
264 aa  211  9e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  40.87 
 
 
264 aa  201  9e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  43.75 
 
 
268 aa  193  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  41.67 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.7 
 
 
249 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.3 
 
 
253 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.3 
 
 
253 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  36.47 
 
 
263 aa  178  7e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  38.3 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  35.77 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.17 
 
 
259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 
246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.18 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  35.9 
 
 
251 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  40.93 
 
 
236 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 
264 aa  169  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  36.61 
 
 
262 aa  168  8e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.93 
 
 
233 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.08 
 
 
292 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.6 
 
 
251 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  36.44 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.43 
 
 
233 aa  164  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.16 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.01 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  40.93 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  40.24 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  38.63 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  39.24 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  37.4 
 
 
256 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  36.97 
 
 
276 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  37.14 
 
 
245 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  40.39 
 
 
304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  39.61 
 
 
309 aa  161  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.32 
 
 
259 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  40.83 
 
 
241 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  38.68 
 
 
236 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.32 
 
 
246 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 
340 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  39.26 
 
 
236 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  33.74 
 
 
240 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.2 
 
 
256 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.2 
 
 
256 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.87 
 
 
267 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  35.17 
 
 
228 aa  158  6e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.27 
 
 
248 aa  158  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  37.39 
 
 
276 aa  158  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  35.19 
 
 
240 aa  158  8e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  40.31 
 
 
259 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  37.64 
 
 
289 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  38.02 
 
 
236 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0944  undecaprenyl diphosphate synthase  35.98 
 
 
230 aa  156  3e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0337161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 
261 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.68 
 
 
247 aa  156  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  35.44 
 
 
272 aa  155  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  36.17 
 
 
247 aa  155  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  35.92 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>