More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_05130 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
257 aa  520  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.26 
 
 
253 aa  332  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  61.42 
 
 
257 aa  322  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  61.02 
 
 
271 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.9 
 
 
254 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62 
 
 
258 aa  304  8.000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.8 
 
 
279 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  57.03 
 
 
257 aa  300  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  58.37 
 
 
255 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  57.75 
 
 
253 aa  298  7e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  58.37 
 
 
253 aa  296  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  58.2 
 
 
253 aa  296  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  58.59 
 
 
253 aa  295  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  58 
 
 
259 aa  291  6e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.1 
 
 
251 aa  287  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  58.1 
 
 
259 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  56.15 
 
 
255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  57.66 
 
 
259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.38 
 
 
252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  57.59 
 
 
257 aa  285  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.44 
 
 
262 aa  285  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  57.03 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  60.78 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  58.37 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.77 
 
 
259 aa  280  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  56.45 
 
 
260 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  57.81 
 
 
263 aa  278  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  55.91 
 
 
256 aa  278  8e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  58.04 
 
 
262 aa  276  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  55.51 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  54.9 
 
 
256 aa  272  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.94 
 
 
259 aa  256  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  52.17 
 
 
258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.05 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.05 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  44.09 
 
 
263 aa  248  5e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.33 
 
 
246 aa  244  9e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.98 
 
 
276 aa  236  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 
278 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  42.69 
 
 
258 aa  230  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.27 
 
 
264 aa  222  4e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  40.64 
 
 
264 aa  221  6e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  39.84 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  40.16 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  40.16 
 
 
263 aa  210  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  45.82 
 
 
283 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 
268 aa  209  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.92 
 
 
249 aa  202  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.85 
 
 
259 aa  200  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.59 
 
 
253 aa  195  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.59 
 
 
253 aa  195  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  41.28 
 
 
245 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.17 
 
 
258 aa  193  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 
233 aa  191  7e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.16 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  37.24 
 
 
248 aa  189  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  40.64 
 
 
262 aa  188  8e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  42.08 
 
 
259 aa  186  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  38.37 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  41.03 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  42.31 
 
 
236 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.18 
 
 
251 aa  181  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  38.63 
 
 
276 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.4 
 
 
267 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  36.6 
 
 
239 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  41.63 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  39.91 
 
 
234 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.26 
 
 
259 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1945  undecaprenyl diphosphate synthase  42.67 
 
 
231 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.77987 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  37.02 
 
 
228 aa  179  4.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  40.74 
 
 
249 aa  178  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  38.03 
 
 
272 aa  178  9e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  39.45 
 
 
256 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 
247 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.43 
 
 
266 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.9 
 
 
255 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  41.45 
 
 
236 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  36.48 
 
 
246 aa  176  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.68 
 
 
292 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  38.46 
 
 
285 aa  176  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  39.32 
 
 
241 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  41.63 
 
 
233 aa  175  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  41.38 
 
 
236 aa  174  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  36.97 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  41.06 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.33 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  36.95 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_002978  WD0527  undecaprenyl diphosphate synthase  35.27 
 
 
231 aa  174  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 
282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  38.82 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.66 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  41.2 
 
 
340 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  35.71 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.68 
 
 
256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  38.59 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  35.98 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  42.5 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.17 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>