More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0950 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  70.92 
 
 
253 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  69.02 
 
 
271 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  66.67 
 
 
255 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  68.92 
 
 
279 aa  335  3.9999999999999995e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  65.87 
 
 
256 aa  330  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.13 
 
 
254 aa  329  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  65.48 
 
 
256 aa  326  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  63.57 
 
 
259 aa  325  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  63.81 
 
 
257 aa  323  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  65.87 
 
 
256 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  65.87 
 
 
253 aa  321  7e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.68 
 
 
258 aa  319  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  64.14 
 
 
253 aa  317  9e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.31 
 
 
259 aa  317  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  63.6 
 
 
255 aa  316  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  62.79 
 
 
257 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  65.32 
 
 
253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.85 
 
 
251 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  61.2 
 
 
281 aa  296  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  58.57 
 
 
260 aa  295  7e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  61.38 
 
 
253 aa  290  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.56 
 
 
262 aa  288  4e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.1 
 
 
257 aa  287  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  59.27 
 
 
259 aa  285  7e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  55.29 
 
 
258 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  55.91 
 
 
263 aa  278  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  55.69 
 
 
265 aa  278  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  55.73 
 
 
262 aa  276  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.38 
 
 
259 aa  262  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.22 
 
 
253 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  54.44 
 
 
257 aa  255  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.3 
 
 
263 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.3 
 
 
263 aa  255  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.65 
 
 
246 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.41 
 
 
252 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.04 
 
 
276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  47.18 
 
 
278 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  41.31 
 
 
258 aa  225  6e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  48.22 
 
 
283 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  45.16 
 
 
280 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  39.37 
 
 
263 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.58 
 
 
264 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  39.37 
 
 
264 aa  203  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  44.14 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  39.77 
 
 
263 aa  199  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  37.3 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.45 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  38.1 
 
 
264 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.32 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.89 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.89 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.68 
 
 
259 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.03 
 
 
247 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.32 
 
 
258 aa  180  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.33 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  39.18 
 
 
256 aa  175  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  37.08 
 
 
232 aa  175  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 
249 aa  175  8e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  44.3 
 
 
236 aa  175  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  36.21 
 
 
246 aa  174  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  38.06 
 
 
263 aa  174  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.7 
 
 
233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  40.65 
 
 
264 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.08 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  37.85 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 
228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  38.01 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.85 
 
 
233 aa  172  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  43.88 
 
 
236 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.61 
 
 
256 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  39.41 
 
 
276 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.95 
 
 
251 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 
245 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.63 
 
 
248 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  41.67 
 
 
241 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.61 
 
 
256 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.26 
 
 
260 aa  170  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  37.34 
 
 
276 aa  170  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  40.08 
 
 
309 aa  169  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.76 
 
 
249 aa  169  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.48 
 
 
258 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.48 
 
 
257 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  36.29 
 
 
251 aa  168  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2592  undecaprenyl diphosphate synthase  37.13 
 
 
238 aa  168  9e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.427666  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.58 
 
 
255 aa  168  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.46 
 
 
249 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.65 
 
 
258 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  35.83 
 
 
262 aa  167  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  42.68 
 
 
252 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  38.55 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  35.06 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  38.63 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  34.57 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.42 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.4 
 
 
267 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.67 
 
 
248 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  41.7 
 
 
259 aa  166  5e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.98 
 
 
252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>