More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3752 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  100 
 
 
264 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.58 
 
 
259 aa  223  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  47.54 
 
 
258 aa  214  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.76 
 
 
254 aa  209  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  47.37 
 
 
255 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
253 aa  199  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  44.08 
 
 
271 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  46.34 
 
 
253 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 
259 aa  198  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.9 
 
 
279 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  43.85 
 
 
256 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  43.82 
 
 
260 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  45.71 
 
 
253 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  46.28 
 
 
253 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  42.06 
 
 
256 aa  184  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  42.21 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  43.19 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.8 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  43.48 
 
 
281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.16 
 
 
259 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  42.06 
 
 
256 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  46.18 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  41.25 
 
 
257 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 
259 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  40.32 
 
 
263 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  40.24 
 
 
265 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.13 
 
 
258 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.92 
 
 
253 aa  168  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.32 
 
 
263 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.32 
 
 
263 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.1 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  40.49 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.73 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  39.53 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.87 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.34 
 
 
276 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  43.72 
 
 
283 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  38.37 
 
 
259 aa  156  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.63 
 
 
264 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  35.06 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.19 
 
 
252 aa  152  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  34.43 
 
 
263 aa  152  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  33.6 
 
 
264 aa  152  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  40.08 
 
 
278 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  36.84 
 
 
268 aa  152  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  34.14 
 
 
263 aa  151  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  38.06 
 
 
280 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  33.2 
 
 
264 aa  148  9e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  33.2 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  36.25 
 
 
262 aa  142  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.08 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  36.43 
 
 
304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  35 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  35.41 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.05 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 
246 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  33.61 
 
 
276 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  34.14 
 
 
264 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  32.53 
 
 
292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  39.48 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0118  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.14 
 
 
252 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  33.98 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  34.73 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  32.55 
 
 
258 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.91 
 
 
249 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.78 
 
 
233 aa  125  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  36.47 
 
 
255 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.48 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  32.28 
 
 
283 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 
273 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  34.18 
 
 
256 aa  122  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  33.9 
 
 
276 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  33.98 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  33.62 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.34 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3725  undecaprenyl diphosphate synthase  39.34 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  36.03 
 
 
340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3651  undecaprenyl diphosphate synthase  39.34 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0486  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.62 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  33.06 
 
 
288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40498  predicted protein  37.4 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.563879  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  33.91 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  33.61 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  32.37 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  30.58 
 
 
253 aa  119  6e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  33.62 
 
 
272 aa  119  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  35.42 
 
 
247 aa  119  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  34.63 
 
 
246 aa  119  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  34.05 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.76 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0786  undecaprenyl diphosphate synthase  33.62 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.676568 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.56 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.44 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  33.98 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.13 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.03 
 
 
259 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.78 
 
 
246 aa  115  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.47 
 
 
249 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  34.48 
 
 
285 aa  115  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>