More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1887 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  71.31 
 
 		 251 aa  362  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  69.57 
 
 		 253 aa  351  5.9999999999999994e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.82 
 
 		 279 aa  333  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  64.66 
 
 		 257 aa  333  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  64.82 
 
 		 253 aa  329  3e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.8 
 
 		 258 aa  325  5e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  61.35 
 
 		 257 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.3 
 
 		 262 aa  314  9e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  61.75 
 
 		 271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  57.71 
 
 		 253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  59.2 
 
 		 255 aa  298  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  60 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.32 
 
 		 254 aa  296  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58 
 
 		 257 aa  291  6e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  59.11 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  56.3 
 
 		 255 aa  289  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  59.27 
 
 		 259 aa  285  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  56.25 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.57 
 
 		 253 aa  282  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  54.37 
 
 		 257 aa  281  6.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.92 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  56.13 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  54.69 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  56.13 
 
 		 256 aa  268  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  53.15 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.85 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.6 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  52.71 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  50.97 
 
 		 265 aa  251  6e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  50.97 
 
 		 263 aa  250  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  51.17 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.99 
 
 		 276 aa  234  9e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.41 
 
 		 263 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.41 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.49 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  44.53 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  47.27 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  39.76 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  38.65 
 
 		 258 aa  218  5e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  39.37 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  39.76 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  37.85 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.85 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  43.7 
 
 		 268 aa  205  7e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  38.25 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.38 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.6 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.24 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.84 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  40.59 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.17 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  37.61 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.49 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 239 aa  182  6e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.03 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  35.98 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  37.61 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  37.34 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.9 
 
 		 292 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.63 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.63 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.03 
 
 		 249 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 264 aa  178  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0052  undecaprenyl diphosphate synthase  39.66 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000100505  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  36.89 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.5 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  38.63 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.08 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.6 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  37.34 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.5 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.79 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  38.66 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.72 
 
 		 243 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  34.84 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.91 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  38.1 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  39.74 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  37.87 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.05 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  37.29 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  41.81 
 
 		 241 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.24 
 
 		 282 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.76 
 
 		 258 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.59 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  40.95 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  32.92 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  38.72 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  35.66 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.6 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.6 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.57 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  37.24 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.22 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  36.64 
 
 		 240 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  37.25 
 
 		 309 aa  168  8e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  34.76 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>