More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1140 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
262 aa  529  1e-149  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.61 
 
 
255 aa  358  3e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  45.02 
 
 
268 aa  226  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  43.02 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  42.05 
 
 
283 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.36 
 
 
259 aa  206  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  41.8 
 
 
278 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  38.82 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 
264 aa  194  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.64 
 
 
276 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  40.73 
 
 
264 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.73 
 
 
264 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  39.76 
 
 
264 aa  190  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.64 
 
 
257 aa  188  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  39.06 
 
 
263 aa  188  9e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  41.53 
 
 
264 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.92 
 
 
253 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  40.55 
 
 
258 aa  185  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.4 
 
 
233 aa  185  8e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  40.32 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  39.2 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  41.73 
 
 
256 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  38.34 
 
 
257 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  39.17 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  37.94 
 
 
255 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  37.35 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  39.66 
 
 
239 aa  179  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.64 
 
 
258 aa  178  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.17 
 
 
258 aa  177  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.97 
 
 
233 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  37.89 
 
 
253 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.1 
 
 
251 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.23 
 
 
254 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  39.03 
 
 
263 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  39.51 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 
281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  38.43 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  39.56 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  39.76 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  39.26 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.34 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  35.6 
 
 
340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  38.1 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  37.65 
 
 
257 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  38.72 
 
 
257 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  35.97 
 
 
309 aa  171  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.02 
 
 
259 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.73 
 
 
267 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.76 
 
 
292 aa  170  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  34.68 
 
 
304 aa  170  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  40.61 
 
 
225 aa  169  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  38.89 
 
 
248 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.7 
 
 
262 aa  169  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  36.36 
 
 
258 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  39.39 
 
 
245 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  35.94 
 
 
253 aa  168  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  36.61 
 
 
256 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  38.89 
 
 
238 aa  168  8e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.23 
 
 
249 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.9 
 
 
252 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.56 
 
 
259 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  35.83 
 
 
259 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.93 
 
 
258 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  38.22 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  37.66 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1157  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.32 
 
 
234 aa  166  5e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  35.83 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  35.51 
 
 
325 aa  165  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  37.55 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.66 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.45 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  36.33 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.53 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.23 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.1 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.1 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  37.23 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.96 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  36.21 
 
 
272 aa  163  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  36.1 
 
 
264 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  38.4 
 
 
246 aa  163  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  36.43 
 
 
253 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.51 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.54 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  36.71 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1777  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 
238 aa  162  6e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  37.66 
 
 
276 aa  162  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  39.26 
 
 
236 aa  162  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  36.36 
 
 
282 aa  162  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  39.24 
 
 
236 aa  161  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  36.6 
 
 
288 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.27 
 
 
258 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.27 
 
 
258 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.27 
 
 
258 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.27 
 
 
258 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.27 
 
 
258 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  39.58 
 
 
236 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.27 
 
 
258 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  35.59 
 
 
252 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>