More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1157 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1157  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 		 234 aa  473  1e-133  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1777  undecaprenyl diphosphate synthase  87.07 
 
 		 238 aa  417  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0348  undecaprenyl diphosphate synthase  85.34 
 
 		 238 aa  418  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  84.05 
 
 		 238 aa  412  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  41.03 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0786  undecaprenyl diphosphate synthase  42.67 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.676568 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  42.98 
 
 		 268 aa  180  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.88 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 		 264 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.06 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  40.93 
 
 		 278 aa  174  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.32 
 
 		 264 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  40.17 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  39.06 
 
 		 233 aa  168  8e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  40.68 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.49 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.17 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  39.32 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.08 
 
 		 279 aa  165  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.61 
 
 		 243 aa  164  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  36.75 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.52 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  39.32 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2174  undecaprenyl diphosphate synthase  40.09 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  39.39 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  39.66 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  40.25 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  39.91 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.32 
 
 		 267 aa  161  7e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.61 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.87 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.71 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1493  undecaprenyl diphosphate synthase  38.79 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.03 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.91 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.17 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0944  undecaprenyl diphosphate synthase  38.96 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0337161  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  39.39 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.97 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.18 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.69 
 
 		 243 aa  158  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  39.42 
 
 		 263 aa  158  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.97 
 
 		 238 aa  158  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0527  undecaprenyl diphosphate synthase  36.52 
 
 		 231 aa  157  9e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1276  undecaprenyl diphosphate synthase  38.79 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0784677  normal  0.545818 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.97 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.06 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  38.6 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.89 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  38.72 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.55 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.55 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.5 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.5 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  40.77 
 
 		 267 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0789  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.26 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.122515 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.02 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.56 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  37.87 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  39.75 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  40.34 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  37.07 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  39.5 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.55 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  37.39 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.24 
 
 		 257 aa  155  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  35.86 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  39.48 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.15 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  38.89 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.22 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  39.41 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.63 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  39.08 
 
 		 257 aa  154  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.14 
 
 		 251 aa  154  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  36.97 
 
 		 259 aa  154  9e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  37.45 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  40.52 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  36.71 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  37.6 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.14 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.61 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  36.6 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  38.89 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  38.33 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  38.03 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  38.26 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  38.26 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.79 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.42 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.86 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  37.13 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  38.86 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.93 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>