More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0348 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0348  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
238 aa  479  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1777  undecaprenyl diphosphate synthase  92.86 
 
 
238 aa  456  1e-127  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  86.13 
 
 
238 aa  433  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1157  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  85.34 
 
 
234 aa  418  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  41.45 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  40.17 
 
 
263 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  41.7 
 
 
258 aa  191  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  41.03 
 
 
264 aa  190  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  41.53 
 
 
280 aa  187  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.89 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 
263 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  41.35 
 
 
278 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  42.98 
 
 
268 aa  181  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.74 
 
 
249 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0786  undecaprenyl diphosphate synthase  42.67 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.676568 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.42 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  40.17 
 
 
245 aa  171  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.48 
 
 
233 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.08 
 
 
276 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.74 
 
 
243 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.52 
 
 
256 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 
259 aa  166  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.18 
 
 
248 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.51 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  40.77 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.77 
 
 
233 aa  165  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.24 
 
 
252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.66 
 
 
279 aa  164  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.66 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  39.13 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.5 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  39.13 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  41.03 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  38.49 
 
 
260 aa  162  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.63 
 
 
252 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  38.2 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 
232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.19 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.63 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1493  undecaprenyl diphosphate synthase  37.93 
 
 
250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  41.38 
 
 
243 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  37.61 
 
 
257 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  36.64 
 
 
233 aa  162  6e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.24 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  38.03 
 
 
262 aa  160  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  36.13 
 
 
240 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  38.14 
 
 
265 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0944  undecaprenyl diphosphate synthase  38.96 
 
 
230 aa  161  1e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0337161  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.02 
 
 
238 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.75 
 
 
258 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.93 
 
 
251 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 
259 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 
268 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.98 
 
 
251 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.91 
 
 
286 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.24 
 
 
252 aa  159  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  38.1 
 
 
231 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.08 
 
 
258 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  39.06 
 
 
275 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  39.32 
 
 
262 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  36.48 
 
 
251 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  37.66 
 
 
257 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  40.09 
 
 
254 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.56 
 
 
251 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  38.36 
 
 
261 aa  158  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.03 
 
 
267 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  37.66 
 
 
261 aa  158  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.17 
 
 
238 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.61 
 
 
267 aa  158  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.13 
 
 
252 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  38.17 
 
 
247 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  37.66 
 
 
251 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  38.89 
 
 
251 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  35.17 
 
 
247 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1276  undecaprenyl diphosphate synthase  37.07 
 
 
243 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0784677  normal  0.545818 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 
234 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1712  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 
252 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.36 
 
 
245 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  38.16 
 
 
236 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  37.76 
 
 
247 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.39 
 
 
253 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.15 
 
 
267 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  37.29 
 
 
240 aa  155  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0789  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.93 
 
 
245 aa  155  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.122515 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.03 
 
 
253 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.03 
 
 
253 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  36.82 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.3 
 
 
251 aa  155  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  38.94 
 
 
227 aa  155  7e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.25 
 
 
251 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  35.29 
 
 
244 aa  155  7e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.24 
 
 
241 aa  155  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_002978  WD0527  undecaprenyl diphosphate synthase  36.09 
 
 
231 aa  155  8e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.77 
 
 
258 aa  154  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.77 
 
 
258 aa  154  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.77 
 
 
258 aa  154  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.77 
 
 
258 aa  154  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  39.15 
 
 
251 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>