More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0762 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 268 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  50.4 
 
 		 258 aa  261  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  47.41 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  46.25 
 
 		 263 aa  254  7e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  46.15 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.06 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  44.66 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  47.23 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  44.27 
 
 		 264 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.02 
 
 		 292 aa  229  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  46.77 
 
 		 264 aa  228  6e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  45.67 
 
 		 280 aa  227  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  45.02 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  45.35 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.41 
 
 		 276 aa  226  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.61 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  45.88 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.49 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  44.49 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  45.91 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  44.71 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  44 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  42.52 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  45.35 
 
 		 340 aa  209  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  45.88 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  44.88 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.45 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  44.73 
 
 		 276 aa  208  6e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  45.98 
 
 		 271 aa  208  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  43.02 
 
 		 258 aa  208  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  46.86 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.86 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.58 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.67 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  45.28 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  44.9 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.12 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  42.75 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.92 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.56 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.49 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.75 
 
 		 259 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.72 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  43.7 
 
 		 259 aa  205  7e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  43.75 
 
 		 244 aa  204  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.5 
 
 		 267 aa  204  9e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  41.33 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  43.35 
 
 		 247 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.32 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  42.39 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.09 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  44.67 
 
 		 325 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  46.27 
 
 		 253 aa  201  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.04 
 
 		 249 aa  202  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  43.7 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  42.62 
 
 		 249 aa  201  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  44.87 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  44.14 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.11 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  45.31 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.98 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.19 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.04 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  46.03 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  43.92 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  40.93 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  44.49 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.31 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  44.8 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  40.08 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.64 
 
 		 251 aa  198  9e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.64 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.35 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.12 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  43.44 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  42.31 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.68 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.49 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  44.92 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.7 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.7 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  43.3 
 
 		 281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  41.87 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  44.68 
 
 		 245 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.83 
 
 		 256 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  43.66 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  45.53 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.8 
 
 		 249 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  43.23 
 
 		 263 aa  194  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  45.14 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  45.26 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.3 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  42.86 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.22 
 
 		 249 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  46.47 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  43.75 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  40.3 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.8 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>