More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1777 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1777  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0348  undecaprenyl diphosphate synthase  92.86 
 
 		 238 aa  456  1e-127  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  83.61 
 
 		 238 aa  422  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1157  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  87.07 
 
 		 234 aa  417  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  42.37 
 
 		 280 aa  188  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  40.43 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  44.26 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  39.32 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  41.35 
 
 		 278 aa  178  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.61 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0786  undecaprenyl diphosphate synthase  41.81 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.676568 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.74 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  38.03 
 
 		 263 aa  171  9e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.48 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 245 aa  169  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.63 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.34 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  37.55 
 
 		 264 aa  168  6e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.24 
 
 		 276 aa  168  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.59 
 
 		 252 aa  167  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.5 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.03 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  39.32 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.87 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.46 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.2 
 
 		 233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.52 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.46 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  38.03 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  36.97 
 
 		 240 aa  164  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  42.06 
 
 		 267 aa  164  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  39.91 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.02 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.4 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.66 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.89 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  40.43 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.03 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  38.98 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  40.43 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1493  undecaprenyl diphosphate synthase  38.36 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.5 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.06 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  41.38 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  40.17 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.19 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  38.79 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.63 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0944  undecaprenyl diphosphate synthase  37.66 
 
 		 230 aa  162  6e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0337161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  39.42 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2174  undecaprenyl diphosphate synthase  39.66 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  38.79 
 
 		 261 aa  161  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.43 
 
 		 252 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  36.64 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  39 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.27 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  38.49 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.09 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.39 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.89 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.89 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0265  undecaprenyl diphosphate synthase  39.75 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.66 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  38.49 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.49 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  40.52 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  40.52 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  38.4 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  36.48 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0789  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.36 
 
 		 245 aa  158  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.122515 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.18 
 
 		 267 aa  158  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  38.6 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1462  undecaprenyl diphosphate synthase  39.5 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.101817  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  39.06 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  35.71 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.91 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  38.66 
 
 		 257 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3513  undecaprenyl diphosphate synthase  39.08 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.25 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  37.23 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1712  undecaprenyl diphosphate synthase  36.75 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  40.52 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  37.76 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  36.32 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.39 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  40.34 
 
 		 241 aa  155  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.82 
 
 		 257 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  38.94 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1276  undecaprenyl diphosphate synthase  36.21 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0784677  normal  0.545818 
 
 
-
 
NC_002978  WD0527  undecaprenyl diphosphate synthase  36.09 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.2 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.2 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  36.25 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.2 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.2 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>