More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1462 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1462  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.101817  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.14 
 
 
257 aa  299  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  61.4 
 
 
262 aa  288  6e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.53 
 
 
257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  50.83 
 
 
252 aa  264  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
256 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  51 
 
 
275 aa  263  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  54.39 
 
 
261 aa  261  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  49.01 
 
 
271 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  51.01 
 
 
275 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  51.26 
 
 
272 aa  259  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  51.01 
 
 
275 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  51.01 
 
 
275 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  50.61 
 
 
264 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  51.01 
 
 
275 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
251 aa  259  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  57.02 
 
 
260 aa  258  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
256 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  53.3 
 
 
261 aa  257  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  51.64 
 
 
266 aa  257  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.22 
 
 
251 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  56.14 
 
 
260 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  56.14 
 
 
260 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  50.6 
 
 
266 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51 
 
 
275 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51 
 
 
275 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51 
 
 
275 aa  256  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.58 
 
 
267 aa  255  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  55.7 
 
 
260 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  55.7 
 
 
260 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  55.7 
 
 
260 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  55.7 
 
 
260 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  55.7 
 
 
260 aa  254  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  53.95 
 
 
260 aa  254  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  48.77 
 
 
288 aa  254  8e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0567  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.84 
 
 
252 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  50.6 
 
 
275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  50.42 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  49.4 
 
 
274 aa  251  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1018  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.3 
 
 
252 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000425553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.3 
 
 
252 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  53.95 
 
 
260 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.3 
 
 
252 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.51 
 
 
260 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.75 
 
 
253 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  51.75 
 
 
252 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.75 
 
 
252 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.75 
 
 
253 aa  249  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.75 
 
 
252 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.75 
 
 
253 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  51.75 
 
 
253 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.75 
 
 
253 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  49.39 
 
 
245 aa  248  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  47.93 
 
 
246 aa  248  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.19 
 
 
256 aa  248  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  51.09 
 
 
265 aa  247  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
246 aa  247  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  57.71 
 
 
254 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.51 
 
 
267 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
263 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.37 
 
 
251 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.83 
 
 
267 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.32 
 
 
252 aa  246  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
251 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
251 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.4 
 
 
252 aa  244  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0743722  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  50.65 
 
 
251 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  47.41 
 
 
248 aa  244  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  50.65 
 
 
251 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.21 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.77 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.77 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.77 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1541  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.77 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  53.48 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0612  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.56 
 
 
237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204719  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.77 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.4 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  48.5 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.65 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  53.48 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  49.78 
 
 
251 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.84 
 
 
247 aa  243  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
255 aa  243  3e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.76 
 
 
257 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
257 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.96 
 
 
255 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  51.1 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.47 
 
 
241 aa  242  5e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
253 aa  241  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
276 aa  241  7e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  52.63 
 
 
260 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  52.63 
 
 
260 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  52.63 
 
 
260 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  50.87 
 
 
252 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  52.19 
 
 
260 aa  240  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.64 
 
 
251 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>