More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0733 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 257 aa  529  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  65.5 
 
 		 271 aa  350  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  65.37 
 
 		 253 aa  345  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  64.73 
 
 		 255 aa  342  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.2 
 
 		 279 aa  338  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.04 
 
 		 258 aa  332  4e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  63.81 
 
 		 259 aa  323  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  61.63 
 
 		 253 aa  322  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.47 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  61.35 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  60.78 
 
 		 257 aa  314  8e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  62.55 
 
 		 256 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  60.96 
 
 		 253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.2 
 
 		 251 aa  308  6.999999999999999e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  58.37 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  60.16 
 
 		 253 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.03 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  61 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  57.94 
 
 		 257 aa  295  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  58.3 
 
 		 259 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.46 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.64 
 
 		 262 aa  291  5e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.51 
 
 		 253 aa  289  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  53.49 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  54.23 
 
 		 256 aa  272  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  52.87 
 
 		 258 aa  268  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  54.12 
 
 		 281 aa  268  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  51.74 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  50.58 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  51.94 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.86 
 
 		 276 aa  255  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  48.45 
 
 		 260 aa  254  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.69 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.69 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.4 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.29 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  49.22 
 
 		 280 aa  249  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 278 aa  247  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.61 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.47 
 
 		 264 aa  229  5e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  44.19 
 
 		 263 aa  228  5e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  42.47 
 
 		 264 aa  228  6e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  40.54 
 
 		 258 aa  225  4e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  42.86 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  45.95 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.42 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  40.3 
 
 		 268 aa  192  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.85 
 
 		 259 aa  191  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.6 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.6 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.78 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  38.78 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.06 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  41.88 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.15 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  38.14 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.7 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  40.93 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  41.94 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  37.45 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.92 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.45 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.74 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  43.53 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  38.79 
 
 		 239 aa  179  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.3 
 
 		 247 aa  178  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.18 
 
 		 243 aa  178  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  36.97 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  39.33 
 
 		 340 aa  175  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  42.67 
 
 		 247 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  40.85 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.17 
 
 		 250 aa  175  7e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.15 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  38.63 
 
 		 240 aa  175  8e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  41.2 
 
 		 241 aa  174  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.42 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  40.25 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  37.18 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  37.07 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  41.28 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.5 
 
 		 245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  41.45 
 
 		 245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.23 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  38.11 
 
 		 249 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  38.72 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  36.05 
 
 		 276 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  37.74 
 
 		 289 aa  171  6.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.56 
 
 		 249 aa  171  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  40.09 
 
 		 244 aa  171  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.75 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.45 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.07 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.13 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.21 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.21 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  36.05 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>